RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 FANCAO15360 1455 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ANO9A1A5B4 782 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 POTEB2H3BUK9 544 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ATE1O95260 518 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 IL2RAP01589 272 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LIG1P18858 919 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 VARSP26640 1264 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 RAB27AP51159 221 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 RUNDC1Q96C34 613 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD3Q96ES6 412 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CDK15Q96Q40 435 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SARGQ9BW04 601 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PRDM9Q9NQV7 894 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf167Q5SNV9 1468 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WZG4 1122 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SELPP16109 830 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 BCAMP50895 628 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NEK2P51955 445 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MTMR1Q13613 665 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TCEA2Q15560 299 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DMRTA1Q5VZB9 504 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM196AQ6ZSG2 479 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9A9Q8IVB4 645 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NRXN2Q9P2S2 1712 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EGFRP00533 1210 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KRT85P78386 507 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PPP2R5AQ15172 486 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PDXDC1Q6P996 788 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SPATC1Q76KD6 591 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT12Q9BQG2 462 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZNRF3Q9ULT6 936 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 IPPQ9Y573 584 aa3.22□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PRRT4C9JH25 899 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GJB6O95452 261 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MYL1P05976 194 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZAP70P43403 619 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 BCO2Q9BYV7 579 aa3.21□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CLIP1P30622 1438 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MEIS3P2A8K0S8 358 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 BACH1O14867 736 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 BPIP17213 487 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KRT77Q7Z794 578 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MTFR1LQ9H019 292 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PRR36Q9H6K5 1346 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MUC3AQ02505 3323 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TAF1LQ8IZX4 1826 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RASGRP1O95267 797 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TGFB3P10600 412 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 AGMOQ6ZNB7 445 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF511Q8NB15 262 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 E2F7Q96AV8 911 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CEP89Q96ST8 783 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KCNG1Q9UIX4 513 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 EYSQ5T1H1 3165 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GNRH1P01148 92 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RASIP1Q5U651 963 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa3.21□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GVC2 190 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GPR39O43194 453 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 HRO43593 1189 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ASMTLO95671 621 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PPM1EQ8WY54 764 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 STRN4Q9NRL3 753 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LUZP4Q9P127 313 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms