RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364025.1

RN7SKP245-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 245, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP245, Length 320 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP245-201ENST00000364025 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 JAG1P78504 1218 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 ARHGEF6Q15052 776 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 TRIM47Q96LD4 638 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 PALD1Q9ULE6 856 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 PLCG2P16885 1265 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 PSMC4P43686 418 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 SPP2Q13103 211 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 KIF22Q14807 665 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 FLT1P17948 1338 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 CAP2P40123 477 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 TREML2Q5T2D2 321 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZNF333Q96JL9 665 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 BCRP11274 1271 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 DNAJC18Q9H819 358 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 DOCK2Q92608 1830 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 HMMRO75330 724 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 OSBPP22059 807 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAP3K12Q12852 859 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 USP17L5A8MUK1 530 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 GDF11O95390 407 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 HMGCS2P54868 508 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 NBPF11Q86T75 865 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SRRDQ9UH36 339 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 BRCA2P51587 3418 aa14.62□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 GOLIM4O00461 696 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 IGSF3O75054 1194 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 RAB11FIP3O75154 756 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 GNRH1P01148 92 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 USP5P45974 858 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 PDE3AQ14432 1141 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 GABRQQ9UN88 632 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 PDE6AP16499 860 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 PRKCZQ05513 592 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 WDR18Q9BV38 432 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 HLA-DOAP06340 250 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ASNSP08243 561 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 HOXD10P28358 340 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 PRMT2P55345 433 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 FCGRTP55899 365 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 EVX2Q03828 476 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MTMR2Q13614 643 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MTFR1Q15390 333 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 RAET1EQ8TD07 263 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 MYPNQ86TC9 1320 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.59□□□□□ -0.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.58□□□□□ -0.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 PEX10O60683 326 aa14.58□□□□□ -0.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 CHGBP05060 677 aa14.58□□□□□ -0.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 PLCD1P51178 756 aa14.58□□□□□ -0.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms