RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356825.8

SMAD2-202, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD2, Length 10,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-202ENST00000356825 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 PLXNC1O60486 1568 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 NIM1KQ8IY84 436 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 TEKT1Q969V4 418 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 RPS6KA2Q15349 733 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 USH1GQ495M9 461 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.97■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 ALDH1L1O75891 902 aa15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 KRT81Q14533 505 aa15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 ATL3Q6DD88 541 aa15.96■□□□□ 0.15
SMAD2-202ENST00000356825 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF131P52739 623 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 PSMD6Q15008 389 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 NBPF11Q86T75 865 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 PDE6BP35913 854 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 TYRO3Q06418 890 aa15.96■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 CSADQ9Y600 493 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 RUFY3Q7L099 469 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 PPFIA2O75334 1257 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 SLC39A6Q13433 755 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ATP6V1E1P36543 226 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 HAUS1Q96CS2 278 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 TBC1D8O95759 1140 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 IFT20Q8IY31 132 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 STX17P56962 302 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ANXA1P04083 346 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 KRT3P12035 628 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 MYCT1Q8N699 235 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 HAUS8Q9BT25 410 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 STMN1P16949 149 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 SLC1A4P43007 532 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 APOBRQ0VD83 1088 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 F13A1P00488 732 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ABL1P00519 1130 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 DNM3Q9UQ16 869 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ESYT2A0FGR8 921 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 NBPF3Q9H094 633 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 DENND2CQ68D51 928 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ZFYVE9O95405 1425 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 MYH11P35749 1972 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 TRIM50Q86XT4 487 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD2-202ENST00000356825 DACT1Q9NYF0 836 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms