RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 WASF1Q92558 559 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ATRNO75882 1429 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1B0GTH6 734 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 MAP2K7O14733 419 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 MTF1Q14872 753 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 LY9Q9HBG7 655 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 MCAMP43121 646 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 PLCD1P51178 756 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 KANK3Q6NY19 840 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 POTEB2H3BUK9 544 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 KIF5CO60282 957 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 CEP112Q8N8E3 955 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 MYL10Q9BUA6 226 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 BTBD18B2RXH4 712 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 MMP1P03956 469 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 GRIN1Q05586 938 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 MED15Q96RN5 788 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 H3BQF6 201 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 CDC23Q9UJX2 597 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 LIFRP42702 1097 aa20.91■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 GYS2P54840 703 aa20.91■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 LMAN1P49257 510 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TUBB4BP68371 445 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TUBB2AQ13885 445 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 UBE3CQ15386 1083 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 IFNAR1P17181 557 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 SPATA20Q8TB22 786 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ALS2Q96Q42 1657 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 USP5P45974 858 aa20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 HDXQ7Z353 690 aa20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
LRRC25-201ENST00000339007 ERLIN1O75477 346 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 RBL2Q08999 1139 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 METTL24Q5JXM2 366 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 RAB21Q9UL25 225 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 VGLL3A8MV65 326 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 TEX33O43247 280 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 GUCY1A2P33402 732 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 MCM6Q14566 821 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 COL18A1P39060 1754 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 TCIRG1Q13488 830 aa20.87■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 SPATA1Q5VX52 437 aa20.87■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.87■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
LRRC25-201ENST00000339007 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms