RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 LAMA4Q16363 1823 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-202ENST00000319107 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 CDC45O75419 566 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 MYH8P13535 1937 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 CSRNP1Q96S65 589 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 IL25Q9H293 177 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXP2O15409 715 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 HOOK2Q96ED9 719 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC10A3P09131 477 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 PALD1Q9ULE6 856 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 SGSM2O43147 1006 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 VPS53Q5VIR6 699 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 CASC1Q6TDU7 716 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 ZIC5Q96T25 663 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 DOCK1Q14185 1865 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 ZMYM6O95789 1325 aa24.14■■□□□ 1.46
RALGPS1-202ENST00000319107 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 HLA-DOAP06340 250 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 MOB2Q70IA6 237 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 APPP05067 770 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 TDO2P48775 406 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 DCAF15Q66K64 600 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 TTC6Q86TZ1 520 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 PRKG1Q13976 671 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 NAPBQ9H115 298 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 EHD4Q9H223 541 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 TBC1D12O60347 775 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 SOX10P56693 466 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K10Q02779 954 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K11Q16584 847 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 SBK1Q52WX2 424 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 CTR9Q6PD62 1173 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L12C9JPN9 530 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L21D6R901 530 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 CYP2D6P10635 497 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 ALX1Q15699 326 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 C12orf60Q5U649 245 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 FZD1Q9UP38 647 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 PLCD1P51178 756 aa24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 EVX2Q03828 476 aa24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 DNAJC18Q9H819 358 aa24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 RNF186Q9NXI6 227 aa24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 UNCXA6NJT0 531 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM196BA6NMK8 535 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 TRPA1O75762 1119 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 SLURP2P0DP57 97 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-202ENST00000319107 GABPAQ06546 454 aa24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-202ENST00000319107 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-202ENST00000319107 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-202ENST00000319107 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-202ENST00000319107 FGAP02671 866 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms