RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PLCG2P16885 1265 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RXRAP19793 462 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 F13A1P00488 732 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MCTP1Q6DN14 999 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL10Q9BUA6 226 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC27P30260 824 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TNKSO95271 1327 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCP20941 246 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 MICU3Q86XE3 530 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 TEKT1Q969V4 418 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 NMT2O60551 498 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CRKP46108 304 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 WTAPQ15007 396 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 NFXL1Q6ZNB6 911 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 NID2Q14112 1375 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB43O43298 467 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 MRIQ9BWK5 157 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAK2O60296 914 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE4BQ07343 736 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 NTRK3Q16288 839 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC69A6NI79 296 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 USP40Q9NVE5 1235 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 TMTC2Q8N394 836 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ERICH2A1L162 156 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FERMT3Q86UX7 667 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 NFIAQ12857 509 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PICALMQ13492 652 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 SOGA3Q5TF21 947 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 RCSD1Q6JBY9 416 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCA1Q86XH1 822 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 IL17RBQ9NRM6 502 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8AA7E2F4 631 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS33BQ9H267 617 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CPLX1O14810 134 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD17O75943 681 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 RASA1P20936 1047 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 TFAP4Q01664 338 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPY2A6NKD2 308 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6L22H0YM25 854 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 NFKBIEO00221 500 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL34Q8N239 644 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PHKBQ93100 1093 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 GMLQ99445 158 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD14O00487 310 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK8P49336 464 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 298.2 ms