RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 PPFIA1Q13136 1202 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 VPS37DQ86XT2 251 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SNRKQ9NRH2 765 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CPP00450 1065 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 IFT88Q13099 833 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 COG1Q8WTW3 980 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 AIDAQ96BJ3 306 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ACEP12821 1306 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 BTBD11A6QL63 1104 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PRC1O43663 620 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TUBBP07437 444 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 NLRP6P59044 892 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SLC39A14Q15043 492 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 POSTNQ15063 836 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PROSER3Q2NL68 480 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC122Q5T0U0 273 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SH2D3CQ8N5H7 860 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 STAMQ92783 540 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MMS19Q96T76 1030 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CASP1P29466 404 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SARNPP82979 210 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 C2orf54Q08AI8 447 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 LGR6Q9HBX8 967 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF10O15013 1369 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MED23Q9ULK4 1368 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 KRT9P35527 623 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SAR1BQ9Y6B6 198 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 HSF2BPO75031 334 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 HPDP32754 393 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TUBB4BP68371 445 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SLC7A5Q01650 507 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CHUKO15111 745 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 USP14P54578 494 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 IQCA1Q86XH1 822 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC181Q5TID7 509 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CNGA4Q8IV77 575 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TAB2Q9NYJ8 693 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF185O15231 689 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TUBB2AQ13885 445 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 KRT40Q6A162 431 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TUBB2BQ9BVA1 445 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 BMP6P22004 513 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MYL10Q9BUA6 226 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 OPA1O60313 960 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MYBL2P10244 700 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 GCKP35557 465 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MLKLQ8NB16 471 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D31Q96DN5 1066 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PANX2Q96RD6 677 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 MFAP3LO75121 409 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 IDEP14735 1019 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms