RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CYP2C19P33261 490 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CASP7P55210 303 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MED15Q96RN5 788 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TRDNQ13061 729 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 MCAMP43121 646 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 SLC39A14Q15043 492 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 VSTM4Q8IW00 320 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CACNA1FO60840 1977 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CMA1P23946 247 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 METTL24Q5JXM2 366 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 BTG4Q9NY30 223 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TNS2Q63HR2 1409 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 RGS22Q8NE09 1264 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 EPSTI1Q96J88 318 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 WNT7AO00755 349 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ENC1O14682 589 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 FAM193AP78312 1265 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PQ27 194 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PQ64 194 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PQD8 194 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CCDC102BQ68D86 513 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TMEM139Q8IV31 216 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TC2NQ8N9U0 490 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PNKPQ96T60 521 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 STRN4Q9NRL3 753 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 APOA5Q6Q788 366 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 BARGINQ6ZT62 677 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PLIN2Q99541 437 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ARMT1Q9H993 441 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CABP5Q9NP86 173 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 FAM170AA1A519 330 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 YEATS4O95619 227 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PHKA1P46020 1223 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 VPS72Q15906 364 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 BCL9O00512 1426 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 TRIM29Q14134 588 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 EVX2Q03828 476 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PTPAQ15257 358 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ZBTB43O43298 467 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 RBL2Q08999 1139 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CCDC102AQ96A19 550 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 GREM2Q9H772 168 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 NHSQ6T4R5 1651 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 A0A087X0B3 334 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX1-201ENST00000261889 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms