RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 TFAP4Q01664 338 aa25.95■■□□□ 1.74
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TARBP1-201ENST00000040877 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.95■■□□□ 1.74
TARBP1-201ENST00000040877 TIGD1Q96MW7 591 aa25.95■■□□□ 1.74
TARBP1-201ENST00000040877 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.95■■□□□ 1.74
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TARBP1-201ENST00000040877 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.93■■□□□ 1.74
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TARBP1-201ENST00000040877 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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TARBP1-201ENST00000040877 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.91■■□□□ 1.74
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TARBP1-201ENST00000040877 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.89■■□□□ 1.73
TARBP1-201ENST00000040877 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TARBP1-201ENST00000040877 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.88■■□□□ 1.73
TARBP1-201ENST00000040877 CIAO1O76071 339 aa25.88■■□□□ 1.73
TARBP1-201ENST00000040877 SNX16P57768 344 aa25.88■■□□□ 1.73
TARBP1-201ENST00000040877 IQCDQ96DY2 449 aa25.88■■□□□ 1.73
TARBP1-201ENST00000040877 ERVK-7P63135 1459 aa25.88■■□□□ 1.73
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