RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CpvlQ9D3S9 478 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Popdc2Q9ES82 367 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Acad12D3Z7X0 555 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Traf3ip1Q149C2 625 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Esyt2Q3TZZ7 845 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep131Q62036 1060 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HelbQ6NVF4 1074 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 QarsQ8BML9 775 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps53Q8CCB4 832 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pus7lQ8CE46 702 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Emilin2Q8K482 1074 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vnn1Q9Z0K8 512 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A1L1SQF0 893 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bnip3O55003 187 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hspa1lP16627 641 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dynll1P63168 89 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dbndd1Q9CZ00 160 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc37Q61081 379 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sass6Q80UK7 654 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Efcc1Q9JJF6 558 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GakQ99KY4 1305 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5592Q3V0A6 857 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Panx2Q6IMP4 677 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ehd2Q8BH64 543 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map3k15A2AQW0 1331 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb21E9Q444 1094 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa1468Q148V7 1216 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam89aQ14BJ1 175 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep135Q6P5D4 1140 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf653Q6YND2 615 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Otop3Q80UF9 577 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8BT18 775 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CerkQ8K4Q7 531 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Creld2Q9CYA0 350 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adarb2Q9JI20 745 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lmbr1Q9JIT0 490 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tob2Q9JM55 345 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prr16A3KMN5 304 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc121E9Q6D3 323 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mapkapk5O54992 473 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nap1l2P51860 460 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DSCC1Q14AI0 399 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serpina10Q8R121 448 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Etnk1Q9D4V0 363 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfyve9A2A8R0 1397 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TbcaP48428 108 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Otud6bQ8K2H2 294 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tubb4aQ9D6F9 444 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ltbp1Q8CG19 1712 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col20a1Q923P0 1320 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 InhbeO08717 350 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PparaP23204 468 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp251Q6PCX8 632 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adgra3Q7TT36 1310 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ltn1Q6A009 1767 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Surf1P09925 306 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eva1cP58659 440 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nxf2Q4ZGD8 691 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myh13B1AR69 1938 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7347D3YYI9 267 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aknad1E9Q8N6 675 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Speer4aF8VPX6 267 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc1a4O35874 532 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Celf1P28659 486 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tdo2P48776 406 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nbr1P97432 988 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kmt5bQ3U8K7 883 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpatch11Q3UFS4 262 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp4x1Q6A152 507 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttll4Q80UG8 1193 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Calml3Q9D6P8 149 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myo1aO88329 1043 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grin1P35438 938 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CebpaP53566 359 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tas2r124Q7M718 309 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde5aQ8CG03 865 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tfcp2Q9ERA0 502 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Letm1Q9Z2I0 738 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf568E9PYI1 671 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5624F6ZZG8 207 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GmnnO88513 206 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rad23bP54728 416 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62 ms