RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635231.1

QARS-238, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-238	ENST00000635231	MT1M	Q8N339	61 aa		3.72	□□□□□ -1.81
QARS-238	ENST00000635231	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.7	□□□□□ -1.82
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.69	□□□□□ -1.82
QARS-238	ENST00000635231	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.69	□□□□□ -1.82
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.68	□□□□□ -1.82
QARS-238	ENST00000635231	MT1L	Q93083	61 aa		3.68	□□□□□ -1.82
QARS-238	ENST00000635231	PSPHP1	O15172	72 aa		3.65	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231		Q1T7F1	81 aa		3.65	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.63	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	COA5	Q86WW8	74 aa		3.63	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.63	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231		H7BZZ5	65 aa		3.62	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.61	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231		A0A1B0GU33	70 aa		3.6	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.6	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.6	□□□□□ -1.83
QARS-238	ENST00000635231	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.58	□□□□□ -1.84
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.57	□□□□□ -1.84
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.56	□□□□□ -1.84
QARS-238	ENST00000635231	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.55	□□□□□ -1.84
QARS-238	ENST00000635231	TNP1	P09430	55 aa		3.54	□□□□□ -1.84
QARS-238	ENST00000635231	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.51	□□□□□ -1.85
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.49	□□□□□ -1.85
QARS-238	ENST00000635231	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.46	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.46	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231		A0A1B0GU69	56 aa		3.45	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.45	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231		A8MU10	97 aa		3.44	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.44	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.44	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QARS-238	ENST00000635231	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
QARS-238	ENST00000635231		A6NED7	52 aa		3.36	□□□□□ -1.87
QARS-238	ENST00000635231	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.33	□□□□□ -1.88
QARS-238	ENST00000635231		K7ERS5	55 aa		3.32	□□□□□ -1.88
QARS-238	ENST00000635231	ROMO1	P60602	79 aa		3.32	□□□□□ -1.88
QARS-238	ENST00000635231	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.28	□□□□□ -1.88
QARS-238	ENST00000635231	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		3.26	□□□□□ -1.89
QARS-238	ENST00000635231	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.25	□□□□□ -1.89
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.25	□□□□□ -1.89
QARS-238	ENST00000635231	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.24	□□□□□ -1.89
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.23	□□□□□ -1.89
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.23	□□□□□ -1.89
QARS-238	ENST00000635231	UQCR11	O14957	56 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.17	□□□□□ -1.9
QARS-238	ENST00000635231	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
QARS-238	ENST00000635231	MT1A	P04731	61 aa		3.14	□□□□□ -1.91
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.13	□□□□□ -1.91
QARS-238	ENST00000635231	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.13	□□□□□ -1.91
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.11	□□□□□ -1.91
QARS-238	ENST00000635231	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.1	□□□□□ -1.91
QARS-238	ENST00000635231	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.08	□□□□□ -1.92
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.07	□□□□□ -1.92
QARS-238	ENST00000635231	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.06	□□□□□ -1.92
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.05	□□□□□ -1.92
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.03	□□□□□ -1.92
QARS-238	ENST00000635231	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.01	□□□□□ -1.93
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		2.92	□□□□□ -1.94
QARS-238	ENST00000635231	MT3	P25713	68 aa		2.9	□□□□□ -1.95
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.89	□□□□□ -1.95
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.72	□□□□□ -1.97
QARS-238	ENST00000635231	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.71	□□□□□ -1.98
QARS-238	ENST00000635231	INE1	O15225	51 aa		2.7	□□□□□ -1.98
QARS-238	ENST00000635231	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.57	□□□□□ -2
QARS-238	ENST00000635231	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.51	□□□□□ -2.01
QARS-238	ENST00000635231	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.36	□□□□□ -2.03
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.29	□□□□□ -2.04
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
QARS-238	ENST00000635231	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.23	□□□□□ -2.05
QARS-238	ENST00000635231	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.18	□□□□□ -2.06
QARS-238	ENST00000635231	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.06	□□□□□ -2.08
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.05	□□□□□ -2.08
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.91	□□□□□ -2.1
QARS-238	ENST00000635231	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.9	□□□□□ -2.11
QARS-238	ENST00000635231	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.68	□□□□□ -2.14
QARS-238	ENST00000635231	PRM1	P04553	51 aa		1.45	□□□□□ -2.18
QARS-238	ENST00000635231	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.34	□□□□□ -2.19

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms