RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.48□□□□□ -1.53
NPIPB11-202ENST00000614927 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.46□□□□□ -1.53
NPIPB11-202ENST00000614927 SPRR2EP22531 72 aa5.45□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 SPRR2BP35325 72 aa5.45□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 SPRR2AP35326 72 aa5.45□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.45□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 MT1EP04732 61 aa5.44□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.41□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 MDN1Q9NU22 5596 aa5.41□□□□□ -1.54
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP12-3P60328 96 aa5.38□□□□□ -1.55
NPIPB11-202ENST00000614927 NEBP20929 6669 aa5.38□□□□□ -1.55
NPIPB11-202ENST00000614927 PP632Q6XCG6 107 aa5.34□□□□□ -1.55
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.34□□□□□ -1.55
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.33□□□□□ -1.56
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.29□□□□□ -1.56
NPIPB11-202ENST00000614927 SPRR2DP22532 72 aa5.27□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 MT1LQ93083 61 aa5.27□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 A0A0A0MQY5 61 aa5.25□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.25□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.23□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 MT1GP13640 62 aa5.22□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.22□□□□□ -1.57
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE4AQ5TA78 99 aa5.2□□□□□ -1.58
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.17□□□□□ -1.58
NPIPB11-202ENST00000614927 PRAC1Q96KF2 57 aa5.16□□□□□ -1.58
NPIPB11-202ENST00000614927 MT1MQ8N339 61 aa5.14□□□□□ -1.59
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.14□□□□□ -1.59
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.11□□□□□ -1.59
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.11□□□□□ -1.59
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.06□□□□□ -1.6
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.99□□□□□ -1.61
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.97□□□□□ -1.61
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.97□□□□□ -1.61
NPIPB11-202ENST00000614927 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.69□□□□□ -1.66
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.69□□□□□ -1.66
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.61□□□□□ -1.67
NPIPB11-202ENST00000614927 MT4P47944 62 aa4.59□□□□□ -1.67
NPIPB11-202ENST00000614927 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.53□□□□□ -1.68
NPIPB11-202ENST00000614927 LUZP6Q538Z0 58 aa4.49□□□□□ -1.69
NPIPB11-202ENST00000614927 MT1AP04731 61 aa4.48□□□□□ -1.69
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP12-4P60329 112 aa4.46□□□□□ -1.7
NPIPB11-202ENST00000614927 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.46□□□□□ -1.7
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.45□□□□□ -1.7
NPIPB11-202ENST00000614927 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.43□□□□□ -1.7
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.35□□□□□ -1.71
NPIPB11-202ENST00000614927 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
NPIPB11-202ENST00000614927 NDUFAF8A1L188 74 aa4.32□□□□□ -1.72
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.18□□□□□ -1.74
NPIPB11-202ENST00000614927 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.12□□□□□ -1.75
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.1□□□□□ -1.75
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.1□□□□□ -1.75
NPIPB11-202ENST00000614927 MT3P25713 68 aa4.09□□□□□ -1.75
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.96□□□□□ -1.78
NPIPB11-202ENST00000614927 INE1O15225 51 aa3.83□□□□□ -1.8
NPIPB11-202ENST00000614927 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.75□□□□□ -1.81
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-8O75690 187 aa3.72□□□□□ -1.81
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.69□□□□□ -1.82
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE1EQ5T753 118 aa3.61□□□□□ -1.83
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.61□□□□□ -1.83
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.55□□□□□ -1.84
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
NPIPB11-202ENST00000614927 MUC5ACP98088 5654 aa3.5□□□□□ -1.85
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.46□□□□□ -1.86
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.43□□□□□ -1.86
NPIPB11-202ENST00000614927 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
NPIPB11-202ENST00000614927 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE1FQ5T754 118 aa3.4□□□□□ -1.87
NPIPB11-202ENST00000614927 LCE1CQ5T751 118 aa3.35□□□□□ -1.87
NPIPB11-202ENST00000614927 PRM1P04553 51 aa2.93□□□□□ -1.94
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.91□□□□□ -1.94
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.9□□□□□ -1.95
NPIPB11-202ENST00000614927 PHGR1C9JFL3 82 aa2.58□□□□□ -2
NPIPB11-202ENST00000614927 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.27□□□□□ -2.05
NPIPB11-202ENST00000614927 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.83□□□□□ -2.12
NPIPB11-202ENST00000614927 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms