RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.61	□□□□□ -1.51
FCHO1-222	ENST00000597718	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.59	□□□□□ -1.51
FCHO1-222	ENST00000597718	TNP1	P09430	55 aa		5.54	□□□□□ -1.52
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FCHO1-222	ENST00000597718	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.52	□□□□□ -1.53
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.49	□□□□□ -1.53
FCHO1-222	ENST00000597718	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.32	□□□□□ -1.56
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.3	□□□□□ -1.56
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.27	□□□□□ -1.57
FCHO1-222	ENST00000597718	MT1E	P04732	61 aa		5.26	□□□□□ -1.57
FCHO1-222	ENST00000597718	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.24	□□□□□ -1.57
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.21	□□□□□ -1.58
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FCHO1-222	ENST00000597718	MT1G	P13640	62 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FCHO1-222	ENST00000597718	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FCHO1-222	ENST00000597718	MT1M	Q8N339	61 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.01	□□□□□ -1.61
FCHO1-222	ENST00000597718	MT1L	Q93083	61 aa		5	□□□□□ -1.61
FCHO1-222	ENST00000597718	MT4	P47944	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FCHO1-222	ENST00000597718	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FCHO1-222	ENST00000597718	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FCHO1-222	ENST00000597718	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FCHO1-222	ENST00000597718	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FCHO1-222	ENST00000597718	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FCHO1-222	ENST00000597718	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.29	□□□□□ -1.72
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FCHO1-222	ENST00000597718	MT1A	P04731	61 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FCHO1-222	ENST00000597718		A0A0A0MQY5	61 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FCHO1-222	ENST00000597718		H3BS24	57 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FCHO1-222	ENST00000597718	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
FCHO1-222	ENST00000597718	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FCHO1-222	ENST00000597718	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FCHO1-222	ENST00000597718	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.02	□□□□□ -1.77
FCHO1-222	ENST00000597718	INE1	O15225	51 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.95	□□□□□ -1.78
FCHO1-222	ENST00000597718	MT3	P25713	68 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.82	□□□□□ -1.8
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.47	□□□□□ -1.85
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.44	□□□□□ -1.86
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.43	□□□□□ -1.86
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FCHO1-222	ENST00000597718	PRM1	P04553	51 aa		3	□□□□□ -1.93
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FCHO1-222	ENST00000597718	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FCHO1-222	ENST00000597718	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.85	□□□□□ -1.95
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.79	□□□□□ -1.96
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.62	□□□□□ -1.99
FCHO1-222	ENST00000597718	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.48	□□□□□ -2.01
FCHO1-222	ENST00000597718	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.21	□□□□□ -2.06
FCHO1-222	ENST00000597718	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.77	□□□□□ -2.13

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.5 ms