RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1MQ8N339 61 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-226ENST00000593200 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1LQ93083 61 aa3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 PRO0628Q9UI54 55 aa3.65□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SNURFQ9Y675 71 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.63□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 H7BZZ5 65 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.6□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.6□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.59□□□□□ -1.83
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP12-1P59990 96 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC61GP60059 68 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 COA5Q86WW8 74 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GU33 70 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 V9GYY9 64 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE3AQ5TA76 89 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-226ENST00000593200 BRK1Q8WUW1 75 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TNP1P09430 55 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 Q1T7F1 81 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PMAIP1Q13794 54 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MU10 97 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP12-3P60328 96 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GU69 56 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PSPHP1O15172 72 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP12-4P60329 112 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.34□□□□□ -1.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR15LQ9BU68 103 aa3.3□□□□□ -1.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.28□□□□□ -1.88
EFTUD2-226ENST00000593200 A6NED7 52 aa3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.16□□□□□ -1.9
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.15□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-8O75690 187 aa3.11□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 MT1AP04731 61 aa3.1□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.1□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC5ACP98088 5654 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAC1Q96KF2 57 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UQCR11O14957 56 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.05□□□□□ -1.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.05□□□□□ -1.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MT3P25713 68 aa3.03□□□□□ -1.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE1FQ5T754 118 aa2.99□□□□□ -1.93
EFTUD2-226ENST00000593200 K7ERS5 55 aa2.97□□□□□ -1.93
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.94□□□□□ -1.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ROMO1P60602 79 aa2.89□□□□□ -1.95
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.88□□□□□ -1.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFAF8A1L188 74 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE1EQ5T753 118 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-226ENST00000593200 LUZP6Q538Z0 58 aa2.65□□□□□ -1.99
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.53□□□□□ -2
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.52□□□□□ -2.01
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE1CQ5T751 118 aa2.48□□□□□ -2.01
EFTUD2-226ENST00000593200 INE1O15225 51 aa2.21□□□□□ -2.06
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.2□□□□□ -2.06
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.18□□□□□ -2.06
EFTUD2-226ENST00000593200 PHGR1C9JFL3 82 aa2.14□□□□□ -2.07
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.04□□□□□ -2.08
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.89□□□□□ -2.11
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.63□□□□□ -2.15
EFTUD2-226ENST00000593200 PRM1P04553 51 aa1.49□□□□□ -2.17
EFTUD2-226ENST00000593200 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms