RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ERS5 55 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PRO0628Q9UI54 55 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HMCN1Q96RW7 5635 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MT4P47944 62 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP12-1P59990 96 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MT1GP13640 62 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE4AQ5TA78 99 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.27□□□□□ -0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PP632Q6XCG6 107 aa9.21□□□□□ -0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MT1MQ8N339 61 aa9.18□□□□□ -0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa9.17□□□□□ -0.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa9.08□□□□□ -0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MT1LQ93083 61 aa9.08□□□□□ -0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa9.06□□□□□ -0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 PMAIP1Q13794 54 aa9.05□□□□□ -0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa9.03□□□□□ -0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.01□□□□□ -0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ROMO1P60602 79 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.83□□□□□ -1
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE3AQ5TA76 89 aa8.8□□□□□ -1
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa8.79□□□□□ -1
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TNP1P09430 55 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP12-3P60328 96 aa8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAC1Q96KF2 57 aa8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP12-4P60329 112 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SVIPQ8NHG7 77 aa8.17□□□□□ -1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.85□□□□□ -1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-8O75690 187 aa7.73□□□□□ -1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MT1AP04731 61 aa7.71□□□□□ -1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC5ACP98088 5654 aa7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OBSCNQ5VST9 7968 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 MT3P25713 68 aa7.05□□□□□ -1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 LUZP6Q538Z0 58 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF8A1L188 74 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE1EQ5T753 118 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE1CQ5T751 118 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A0MQY5 61 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 INE1O15225 51 aa5.59□□□□□ -1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE1FQ5T754 118 aa5.56□□□□□ -1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BS24 57 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.54□□□□□ -1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.38□□□□□ -1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PHGR1C9JFL3 82 aa5.31□□□□□ -1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.62□□□□□ -1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PRM1P04553 51 aa4.59□□□□□ -1.67
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.27□□□□□ -1.89
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