RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GU33 70 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE1FQ5T754 118 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GU69 56 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM258P61165 79 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP12-1P59990 96 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-209ENST00000587957 SMIM26A0A096LP01 95 aa4□□□□□ -1.77
EFTUD2-209ENST00000587957 A8MU10 97 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1EP04732 61 aa3.97□□□□□ -1.77
EFTUD2-209ENST00000587957 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR15LQ9BU68 103 aa3.94□□□□□ -1.78
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-209ENST00000587957 TNP1P09430 55 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE3AQ5TA76 89 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-209ENST00000587957 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-209ENST00000587957 PP632Q6XCG6 107 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1GP13640 62 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1LQ93083 61 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 UQCR11O14957 56 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1MQ8N339 61 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-209ENST00000587957 Q1T7F1 81 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-209ENST00000587957 V9GYY9 64 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-209ENST00000587957 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-209ENST00000587957 MT4P47944 62 aa3.7□□□□□ -1.82
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP12-3P60328 96 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-209ENST00000587957 K7ERS5 55 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-209ENST00000587957 PSPHP1O15172 72 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0A0MQY5 61 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-209ENST00000587957 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-209ENST00000587957 A6NED7 52 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-209ENST00000587957 PRO0628Q9UI54 55 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-209ENST00000587957 BRK1Q8WUW1 75 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-209ENST00000587957 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP12-4P60329 112 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-209ENST00000587957 ROMO1P60602 79 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-209ENST00000587957 SVIPQ8NHG7 77 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-209ENST00000587957 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-209ENST00000587957 PMAIP1Q13794 54 aa3.32□□□□□ -1.88
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-209ENST00000587957 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1AP04731 61 aa3.22□□□□□ -1.89
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.22□□□□□ -1.89
EFTUD2-209ENST00000587957 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFAF8A1L188 74 aa3.17□□□□□ -1.9
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.09□□□□□ -1.91
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE1CQ5T751 118 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-209ENST00000587957 PRAC1Q96KF2 57 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-8O75690 187 aa2.98□□□□□ -1.93
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC5ACP98088 5654 aa2.8□□□□□ -1.96
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
EFTUD2-209ENST00000587957 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.71□□□□□ -1.98
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.58□□□□□ -2
EFTUD2-209ENST00000587957 LUZP6Q538Z0 58 aa2.54□□□□□ -2
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.25□□□□□ -2.05
EFTUD2-209ENST00000587957 INE1O15225 51 aa2.12□□□□□ -2.07
EFTUD2-209ENST00000587957 PHGR1C9JFL3 82 aa2.03□□□□□ -2.08
EFTUD2-209ENST00000587957 PRM1P04553 51 aa1.75□□□□□ -2.13
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.51□□□□□ -2.17
EFTUD2-209ENST00000587957 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms