RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRR2EP22531 72 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRR2BP35325 72 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRR2AP35326 72 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP12-3P60328 96 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE1AQ5T7P2 110 aa9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRR2DP22532 72 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE3BQ5TA77 95 aa9.25□□□□□ -0.93
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0A0MQY5 61 aa9.16□□□□□ -0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE3CQ5T5A8 94 aa9.16□□□□□ -0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa9.13□□□□□ -0.95
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.96□□□□□ -0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 MT1EP04732 61 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 MT1LQ93083 61 aa8.87□□□□□ -0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-204ENST00000587718 MT1GP13640 62 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.52□□□□□ -1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 INE1O15225 51 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 MT1MQ8N339 61 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE1DQ5T752 114 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE4AQ5TA78 99 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 MT4P47944 62 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.11□□□□□ -1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa8.02□□□□□ -1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.97□□□□□ -1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.78□□□□□ -1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.67□□□□□ -1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP12-4P60329 112 aa7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-204ENST00000587718 MT1AP04731 61 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.15□□□□□ -1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-8O75690 187 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.9□□□□□ -1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 MT3P25713 68 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC5ACP98088 5654 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PRM1P04553 51 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE1EQ5T753 118 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.84□□□□□ -1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE1CQ5T751 118 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.31□□□□□ -1.56
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE1FQ5T754 118 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 PHGR1C9JFL3 82 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.36□□□□□ -1.71
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.18□□□□□ -1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.94□□□□□ -1.94
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