RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 INE1O15225 51 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-210ENST00000578916 MT1XP80297 61 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP12-2P59991 146 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-210ENST00000578916 PLAC4Q8WY50 150 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-210ENST00000578916 Q8N9L7 120 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-210ENST00000578916 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-210ENST00000578916 H0YAA0 97 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-210ENST00000578916 LCE4AQ5TA78 99 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-210ENST00000578916 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRM-210ENST00000578916 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-12P60413 245 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-210ENST00000578916 M0QZ58 72 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-210ENST00000578916 PP632Q6XCG6 107 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-210ENST00000578916 LCE1DQ5T752 114 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-210ENST00000578916 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-210ENST00000578916 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRM-210ENST00000578916 MT4P47944 62 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRM-210ENST00000578916 MT1EP04732 61 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-210ENST00000578916 MT1GP13640 62 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-210ENST00000578916 MT3P25713 68 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-210ENST00000578916 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-210ENST00000578916 MT1MQ8N339 61 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0D9SG42 100 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-210ENST00000578916 LCE1FQ5T754 118 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-210ENST00000578916 MT1LQ93083 61 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP12-4P60329 112 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-210ENST00000578916 LCE3AQ5TA76 89 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-210ENST00000578916 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRM-210ENST00000578916 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP12-1P59990 96 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-210ENST00000578916 TNP1P09430 55 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-210ENST00000578916 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-210ENST00000578916 MUC5ACP98088 5654 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-210ENST00000578916 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP12-3P60328 96 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-8O75690 187 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-210ENST00000578916 LCE1EQ5T753 118 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-210ENST00000578916 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-210ENST00000578916 MT1AP04731 61 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRM-210ENST00000578916 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-210ENST00000578916 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRM-210ENST00000578916 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRM-210ENST00000578916 LCE1CQ5T751 118 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
PTPRM-210ENST00000578916 PHGR1C9JFL3 82 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRM-210ENST00000578916 PRM1P04553 51 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.81□□□□□ -2.12
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRM-210ENST00000578916 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.56□□□□□ -2.16
PTPRM-210ENST00000578916 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.21□□□□□ -2.22
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