RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EDC4-210	ENST00000575507	ROMO1	P60602	79 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EDC4-210	ENST00000575507	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
EDC4-210	ENST00000575507	MT1G	P13640	62 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EDC4-210	ENST00000575507	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.09	□□□□□ -1.59
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.08	□□□□□ -1.6
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
EDC4-210	ENST00000575507	MT1L	Q93083	61 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EDC4-210	ENST00000575507	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.05	□□□□□ -1.6
EDC4-210	ENST00000575507	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EDC4-210	ENST00000575507	MT1M	Q8N339	61 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EDC4-210	ENST00000575507	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EDC4-210	ENST00000575507	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDC4-210	ENST00000575507	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EDC4-210	ENST00000575507	MT4	P47944	62 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EDC4-210	ENST00000575507	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EDC4-210	ENST00000575507	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EDC4-210	ENST00000575507	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EDC4-210	ENST00000575507	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EDC4-210	ENST00000575507	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EDC4-210	ENST00000575507	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EDC4-210	ENST00000575507	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EDC4-210	ENST00000575507	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.5	□□□□□ -1.69
EDC4-210	ENST00000575507	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.48	□□□□□ -1.69
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.47	□□□□□ -1.69
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.44	□□□□□ -1.7
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.37	□□□□□ -1.71
EDC4-210	ENST00000575507	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.3	□□□□□ -1.72
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.29	□□□□□ -1.72
EDC4-210	ENST00000575507	MT1A	P04731	61 aa		4.28	□□□□□ -1.72
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EDC4-210	ENST00000575507	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EDC4-210	ENST00000575507	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EDC4-210	ENST00000575507	MT3	P25713	68 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.8	□□□□□ -1.8
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.76	□□□□□ -1.81
EDC4-210	ENST00000575507	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.74	□□□□□ -1.81
EDC4-210	ENST00000575507	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
EDC4-210	ENST00000575507	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
EDC4-210	ENST00000575507	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EDC4-210	ENST00000575507	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EDC4-210	ENST00000575507		H3BS24	57 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.44	□□□□□ -1.86
EDC4-210	ENST00000575507	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EDC4-210	ENST00000575507	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.39	□□□□□ -1.87
EDC4-210	ENST00000575507	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EDC4-210	ENST00000575507		A0A0A0MQY5	61 aa		3.31	□□□□□ -1.88
EDC4-210	ENST00000575507	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.26	□□□□□ -1.89
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.14	□□□□□ -1.91
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EDC4-210	ENST00000575507	INE1	O15225	51 aa		2.99	□□□□□ -1.93
EDC4-210	ENST00000575507	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.91	□□□□□ -1.94
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EDC4-210	ENST00000575507	PRM1	P04553	51 aa		2.67	□□□□□ -1.98
EDC4-210	ENST00000575507	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.64	□□□□□ -1.99
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.62	□□□□□ -1.99
EDC4-210	ENST00000575507	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.37	□□□□□ -2.03
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.98	□□□□□ -2.09
EDC4-210	ENST00000575507	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.72	□□□□□ -2.13

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms