RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 LCE3BQ5TA77 95 aa5.54□□□□□ -1.52
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SPNS3-202ENST00000572078 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.48□□□□□ -1.53
SPNS3-202ENST00000572078 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.46□□□□□ -1.54
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP10-12P60413 245 aa5.44□□□□□ -1.54
SPNS3-202ENST00000572078 TNP1P09430 55 aa5.38□□□□□ -1.55
SPNS3-202ENST00000572078 PP632Q6XCG6 107 aa5.35□□□□□ -1.55
SPNS3-202ENST00000572078 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.3□□□□□ -1.56
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.28□□□□□ -1.56
SPNS3-202ENST00000572078 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.2□□□□□ -1.58
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.17□□□□□ -1.58
SPNS3-202ENST00000572078 MT1EP04732 61 aa5.12□□□□□ -1.59
SPNS3-202ENST00000572078 LCE1DQ5T752 114 aa5.12□□□□□ -1.59
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.12□□□□□ -1.59
SPNS3-202ENST00000572078 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.09□□□□□ -1.59
SPNS3-202ENST00000572078 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.03□□□□□ -1.6
SPNS3-202ENST00000572078 LCE3AQ5TA76 89 aa5.02□□□□□ -1.61
SPNS3-202ENST00000572078 MT4P47944 62 aa5.01□□□□□ -1.61
SPNS3-202ENST00000572078 LCE4AQ5TA78 99 aa4.96□□□□□ -1.62
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.94□□□□□ -1.62
SPNS3-202ENST00000572078 MT1GP13640 62 aa4.93□□□□□ -1.62
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.93□□□□□ -1.62
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.92□□□□□ -1.62
SPNS3-202ENST00000572078 MT1MQ8N339 61 aa4.9□□□□□ -1.63
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.87□□□□□ -1.63
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.87□□□□□ -1.63
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.86□□□□□ -1.63
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP12-3P60328 96 aa4.85□□□□□ -1.63
SPNS3-202ENST00000572078 MT1LQ93083 61 aa4.83□□□□□ -1.64
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.76□□□□□ -1.65
SPNS3-202ENST00000572078 LUZP6Q538Z0 58 aa4.74□□□□□ -1.65
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.73□□□□□ -1.65
SPNS3-202ENST00000572078 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.68□□□□□ -1.66
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.68□□□□□ -1.66
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.64□□□□□ -1.67
SPNS3-202ENST00000572078 NDUFAF8A1L188 74 aa4.62□□□□□ -1.67
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.62□□□□□ -1.67
SPNS3-202ENST00000572078 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.55□□□□□ -1.68
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SPNS3-202ENST00000572078 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
SPNS3-202ENST00000572078 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.41□□□□□ -1.7
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP12-4P60329 112 aa4.4□□□□□ -1.71
SPNS3-202ENST00000572078 H3BS24 57 aa4.31□□□□□ -1.72
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.28□□□□□ -1.72
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0A0MQY5 61 aa4.23□□□□□ -1.73
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.22□□□□□ -1.73
SPNS3-202ENST00000572078 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
SPNS3-202ENST00000572078 MUC5ACP98088 5654 aa4.19□□□□□ -1.74
SPNS3-202ENST00000572078 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.18□□□□□ -1.74
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-8O75690 187 aa4.18□□□□□ -1.74
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.13□□□□□ -1.75
SPNS3-202ENST00000572078 MT1AP04731 61 aa4.09□□□□□ -1.75
SPNS3-202ENST00000572078 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.01□□□□□ -1.77
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.99□□□□□ -1.77
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.98□□□□□ -1.77
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.94□□□□□ -1.78
SPNS3-202ENST00000572078 INE1O15225 51 aa3.92□□□□□ -1.78
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.85□□□□□ -1.79
SPNS3-202ENST00000572078 MT3P25713 68 aa3.71□□□□□ -1.82
SPNS3-202ENST00000572078 LCE1EQ5T753 118 aa3.49□□□□□ -1.85
SPNS3-202ENST00000572078 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.46□□□□□ -1.86
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.42□□□□□ -1.86
SPNS3-202ENST00000572078 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.39□□□□□ -1.87
SPNS3-202ENST00000572078 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.35□□□□□ -1.87
SPNS3-202ENST00000572078 LCE1CQ5T751 118 aa3.26□□□□□ -1.89
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.22□□□□□ -1.89
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.03□□□□□ -1.92
SPNS3-202ENST00000572078 PRM1P04553 51 aa2.97□□□□□ -1.93
SPNS3-202ENST00000572078 LCE1FQ5T754 118 aa2.94□□□□□ -1.94
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SPNS3-202ENST00000572078 PHGR1C9JFL3 82 aa2.86□□□□□ -1.95
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.74□□□□□ -1.97
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.57□□□□□ -2
SPNS3-202ENST00000572078 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.52□□□□□ -2.01
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.14□□□□□ -2.07
SPNS3-202ENST00000572078 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
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