RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PKD1-238	ENST00000570150	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.59	□□□□□ -1.35
PKD1-238	ENST00000570150	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36
PKD1-238	ENST00000570150	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PKD1-238	ENST00000570150	MT1G	P13640	62 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PKD1-238	ENST00000570150	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.43	□□□□□ -1.38
PKD1-238	ENST00000570150	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.43	□□□□□ -1.38
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.4	□□□□□ -1.38
PKD1-238	ENST00000570150	MT1L	Q93083	61 aa		6.4	□□□□□ -1.38
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PKD1-238	ENST00000570150	MT1M	Q8N339	61 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PKD1-238	ENST00000570150	ROMO1	P60602	79 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PKD1-238	ENST00000570150	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PKD1-238	ENST00000570150	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKD1-238	ENST00000570150	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6	□□□□□ -1.45
PKD1-238	ENST00000570150	MT4	P47944	62 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PKD1-238	ENST00000570150	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PKD1-238	ENST00000570150	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PKD1-238	ENST00000570150	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PKD1-238	ENST00000570150	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PKD1-238	ENST00000570150	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PKD1-238	ENST00000570150	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PKD1-238	ENST00000570150	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PKD1-238	ENST00000570150	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PKD1-238	ENST00000570150	MT1A	P04731	61 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PKD1-238	ENST00000570150	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PKD1-238	ENST00000570150	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PKD1-238	ENST00000570150	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PKD1-238	ENST00000570150	MT3	P25713	68 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PKD1-238	ENST00000570150	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKD1-238	ENST00000570150	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PKD1-238	ENST00000570150	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PKD1-238	ENST00000570150	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PKD1-238	ENST00000570150	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PKD1-238	ENST00000570150	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PKD1-238	ENST00000570150	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PKD1-238	ENST00000570150	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKD1-238	ENST00000570150	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.29	□□□□□ -1.72
PKD1-238	ENST00000570150	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.29	□□□□□ -1.72
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PKD1-238	ENST00000570150	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PKD1-238	ENST00000570150	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PKD1-238	ENST00000570150	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PKD1-238	ENST00000570150	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PKD1-238	ENST00000570150		A0A0A0MQY5	61 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PKD1-238	ENST00000570150	INE1	O15225	51 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PKD1-238	ENST00000570150	PRM1	P04553	51 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PKD1-238	ENST00000570150	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PKD1-238	ENST00000570150		H3BS24	57 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PKD1-238	ENST00000570150	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.51	□□□□□ -2.01
PKD1-238	ENST00000570150	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.16	□□□□□ -2.06

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