RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.11□□□□□ -1.27
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.09□□□□□ -1.27
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR2EP22531 72 aa7.03□□□□□ -1.28
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR2BP35325 72 aa7.03□□□□□ -1.28
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR2AP35326 72 aa7.03□□□□□ -1.28
SPNS1-210ENST00000568388 PP632Q6XCG6 107 aa7□□□□□ -1.29
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.98□□□□□ -1.29
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.98□□□□□ -1.29
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.98□□□□□ -1.29
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.96□□□□□ -1.3
SPNS1-210ENST00000568388 LCE4AQ5TA78 99 aa6.95□□□□□ -1.3
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.95□□□□□ -1.3
SPNS1-210ENST00000568388 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.93□□□□□ -1.3
SPNS1-210ENST00000568388 MT1EP04732 61 aa6.88□□□□□ -1.31
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP12-3P60328 96 aa6.87□□□□□ -1.31
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.82□□□□□ -1.32
SPNS1-210ENST00000568388 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.81□□□□□ -1.32
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.81□□□□□ -1.32
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR2DP22532 72 aa6.79□□□□□ -1.32
SPNS1-210ENST00000568388 H3BS24 57 aa6.76□□□□□ -1.33
SPNS1-210ENST00000568388 PRAC1Q96KF2 57 aa6.76□□□□□ -1.33
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.75□□□□□ -1.33
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.75□□□□□ -1.33
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.7□□□□□ -1.34
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.69□□□□□ -1.34
SPNS1-210ENST00000568388 MT1LQ93083 61 aa6.69□□□□□ -1.34
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.66□□□□□ -1.34
SPNS1-210ENST00000568388 MT1GP13640 62 aa6.63□□□□□ -1.35
SPNS1-210ENST00000568388 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.63□□□□□ -1.35
SPNS1-210ENST00000568388 MT1MQ8N339 61 aa6.5□□□□□ -1.37
SPNS1-210ENST00000568388 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.4□□□□□ -1.38
SPNS1-210ENST00000568388 SVIPQ8NHG7 77 aa6.37□□□□□ -1.39
SPNS1-210ENST00000568388 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.3□□□□□ -1.4
SPNS1-210ENST00000568388 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.11□□□□□ -1.43
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.05□□□□□ -1.44
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.05□□□□□ -1.44
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.02□□□□□ -1.45
SPNS1-210ENST00000568388 MT4P47944 62 aa5.93□□□□□ -1.46
SPNS1-210ENST00000568388 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.93□□□□□ -1.46
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.88□□□□□ -1.47
SPNS1-210ENST00000568388 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.8□□□□□ -1.48
SPNS1-210ENST00000568388 MT1AP04731 61 aa5.71□□□□□ -1.5
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.65□□□□□ -1.5
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.62□□□□□ -1.51
SPNS1-210ENST00000568388 LUZP6Q538Z0 58 aa5.61□□□□□ -1.51
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP12-4P60329 112 aa5.58□□□□□ -1.52
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.56□□□□□ -1.52
SPNS1-210ENST00000568388 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.44□□□□□ -1.54
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.24□□□□□ -1.57
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.24□□□□□ -1.57
SPNS1-210ENST00000568388 MT3P25713 68 aa5.2□□□□□ -1.58
SPNS1-210ENST00000568388 NDUFAF8A1L188 74 aa5.17□□□□□ -1.58
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-8O75690 187 aa4.93□□□□□ -1.62
SPNS1-210ENST00000568388 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.82□□□□□ -1.64
SPNS1-210ENST00000568388 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.75□□□□□ -1.65
SPNS1-210ENST00000568388 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SPNS1-210ENST00000568388 MUC5ACP98088 5654 aa4.74□□□□□ -1.65
SPNS1-210ENST00000568388 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SPNS1-210ENST00000568388 LCE1EQ5T753 118 aa4.63□□□□□ -1.67
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.63□□□□□ -1.67
SPNS1-210ENST00000568388 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.58□□□□□ -1.68
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.52□□□□□ -1.69
SPNS1-210ENST00000568388 A0A0A0MQY5 61 aa4.48□□□□□ -1.69
SPNS1-210ENST00000568388 INE1O15225 51 aa4.33□□□□□ -1.72
SPNS1-210ENST00000568388 LCE1CQ5T751 118 aa4.29□□□□□ -1.72
SPNS1-210ENST00000568388 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.29□□□□□ -1.72
SPNS1-210ENST00000568388 PRM1P04553 51 aa3.79□□□□□ -1.8
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.79□□□□□ -1.8
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.71□□□□□ -1.82
SPNS1-210ENST00000568388 LCE1FQ5T754 118 aa3.69□□□□□ -1.82
SPNS1-210ENST00000568388 PHGR1C9JFL3 82 aa3.28□□□□□ -1.88
SPNS1-210ENST00000568388 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.97□□□□□ -1.93
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.48□□□□□ -2.01
SPNS1-210ENST00000568388 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.14□□□□□ -2.07
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