RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 LCE1DQ5T752 114 aa6.95□□□□□ -1.3
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.87□□□□□ -1.31
INO80E-212ENST00000568043 PRO0628Q9UI54 55 aa6.86□□□□□ -1.31
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.85□□□□□ -1.31
INO80E-212ENST00000568043 BRK1Q8WUW1 75 aa6.82□□□□□ -1.32
INO80E-212ENST00000568043 MT1EP04732 61 aa6.81□□□□□ -1.32
INO80E-212ENST00000568043 MT4P47944 62 aa6.79□□□□□ -1.32
INO80E-212ENST00000568043 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.77□□□□□ -1.33
INO80E-212ENST00000568043 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.77□□□□□ -1.33
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.75□□□□□ -1.33
INO80E-212ENST00000568043 LCE4AQ5TA78 99 aa6.73□□□□□ -1.33
INO80E-212ENST00000568043 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.73□□□□□ -1.33
INO80E-212ENST00000568043 TNP1P09430 55 aa6.67□□□□□ -1.34
INO80E-212ENST00000568043 MT1GP13640 62 aa6.61□□□□□ -1.35
INO80E-212ENST00000568043 ROMO1P60602 79 aa6.61□□□□□ -1.35
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.6□□□□□ -1.35
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.58□□□□□ -1.36
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.57□□□□□ -1.36
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.56□□□□□ -1.36
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.54□□□□□ -1.36
INO80E-212ENST00000568043 MT1MQ8N339 61 aa6.53□□□□□ -1.36
INO80E-212ENST00000568043 PP632Q6XCG6 107 aa6.49□□□□□ -1.37
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.46□□□□□ -1.38
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.46□□□□□ -1.38
INO80E-212ENST00000568043 PMAIP1Q13794 54 aa6.43□□□□□ -1.38
INO80E-212ENST00000568043 LCE3AQ5TA76 89 aa6.43□□□□□ -1.38
INO80E-212ENST00000568043 MT1LQ93083 61 aa6.42□□□□□ -1.38
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.4□□□□□ -1.38
INO80E-212ENST00000568043 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-212ENST00000568043 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP12-3P60328 96 aa6.19□□□□□ -1.42
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.14□□□□□ -1.43
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
INO80E-212ENST00000568043 PRAC1Q96KF2 57 aa6.05□□□□□ -1.44
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.98□□□□□ -1.45
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP12-4P60329 112 aa5.95□□□□□ -1.46
INO80E-212ENST00000568043 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.93□□□□□ -1.46
INO80E-212ENST00000568043 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.85□□□□□ -1.47
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.82□□□□□ -1.48
INO80E-212ENST00000568043 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.75□□□□□ -1.49
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-8O75690 187 aa5.67□□□□□ -1.5
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.66□□□□□ -1.5
INO80E-212ENST00000568043 MUC5ACP98088 5654 aa5.62□□□□□ -1.51
INO80E-212ENST00000568043 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
INO80E-212ENST00000568043 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.48□□□□□ -1.53
INO80E-212ENST00000568043 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.45□□□□□ -1.54
INO80E-212ENST00000568043 MT1AP04731 61 aa5.43□□□□□ -1.54
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.4□□□□□ -1.54
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.4□□□□□ -1.54
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.33□□□□□ -1.56
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.32□□□□□ -1.56
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.2□□□□□ -1.58
INO80E-212ENST00000568043 LUZP6Q538Z0 58 aa5.04□□□□□ -1.6
INO80E-212ENST00000568043 MT3P25713 68 aa4.98□□□□□ -1.61
INO80E-212ENST00000568043 NDUFAF8A1L188 74 aa4.87□□□□□ -1.63
INO80E-212ENST00000568043 H3BS24 57 aa4.86□□□□□ -1.63
INO80E-212ENST00000568043 LCE1EQ5T753 118 aa4.7□□□□□ -1.66
INO80E-212ENST00000568043 A0A0A0MQY5 61 aa4.61□□□□□ -1.67
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.57□□□□□ -1.68
INO80E-212ENST00000568043 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.49□□□□□ -1.69
INO80E-212ENST00000568043 LCE1CQ5T751 118 aa4.38□□□□□ -1.71
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.35□□□□□ -1.71
INO80E-212ENST00000568043 INE1O15225 51 aa4.27□□□□□ -1.73
INO80E-212ENST00000568043 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.26□□□□□ -1.73
INO80E-212ENST00000568043 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.11□□□□□ -1.75
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.11□□□□□ -1.75
INO80E-212ENST00000568043 LCE1FQ5T754 118 aa4.01□□□□□ -1.77
INO80E-212ENST00000568043 PHGR1C9JFL3 82 aa3.93□□□□□ -1.78
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.63□□□□□ -1.83
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.43□□□□□ -1.86
INO80E-212ENST00000568043 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.41□□□□□ -1.86
INO80E-212ENST00000568043 PRM1P04553 51 aa3.41□□□□□ -1.86
INO80E-212ENST00000568043 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.96□□□□□ -1.94
INO80E-212ENST00000568043 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.1 ms