RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	KRTAP10-12	P60413	245 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CS-233	ENST00000552688	PRR15L	Q9BU68	103 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CS-233	ENST00000552688	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CS-233	ENST00000552688	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CS-233	ENST00000552688	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CS-233	ENST00000552688	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CS-233	ENST00000552688	KRTAP12-1	P59990	96 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CS-233	ENST00000552688		Q1T7F1	81 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CS-233	ENST00000552688	BRK1	Q8WUW1	75 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	UQCR11	O14957	56 aa		2.63	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	MT3	P25713	68 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CS-233	ENST00000552688	LCE1D	Q5T752	114 aa		2.57	□□□□□ -2
CS-233	ENST00000552688	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		2.57	□□□□□ -2
CS-233	ENST00000552688	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		2.56	□□□□□ -2
CS-233	ENST00000552688	MT1E	P04732	61 aa		2.55	□□□□□ -2
CS-233	ENST00000552688	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.54	□□□□□ -2
CS-233	ENST00000552688	MT1G	P13640	62 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	MT4	P47944	62 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.52	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	2.5	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	TNP1	P09430	55 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	LCE3A	Q5TA76	89 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.5	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		2.48	□□□□□ -2.01
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.46	□□□□□ -2.02
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CS-233	ENST00000552688	MT1M	Q8N339	61 aa		2.44	□□□□□ -2.02
CS-233	ENST00000552688	MT1L	Q93083	61 aa		2.41	□□□□□ -2.02
CS-233	ENST00000552688	ROMO1	P60602	79 aa		2.4	□□□□□ -2.03
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.4	□□□□□ -2.03
CS-233	ENST00000552688	KRTAP12-3	P60328	96 aa		2.37	□□□□□ -2.03
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		2.35	□□□□□ -2.03
CS-233	ENST00000552688	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.34	□□□□□ -2.03
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		2.33	□□□□□ -2.04
CS-233	ENST00000552688	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.32	□□□□□ -2.04
CS-233	ENST00000552688	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.32	□□□□□ -2.04
CS-233	ENST00000552688	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.32	□□□□□ -2.04
CS-233	ENST00000552688	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.29	□□□□□ -2.04
CS-233	ENST00000552688	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.27	□□□□□ -2.05
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
CS-233	ENST00000552688	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		2.18	□□□□□ -2.06
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.18	□□□□□ -2.06
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.11	□□□□□ -2.07
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.1	□□□□□ -2.07
CS-233	ENST00000552688	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		2.09	□□□□□ -2.07
CS-233	ENST00000552688	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
CS-233	ENST00000552688	INE1	O15225	51 aa		2.05	□□□□□ -2.08
CS-233	ENST00000552688	MT1A	P04731	61 aa		2.05	□□□□□ -2.08
CS-233	ENST00000552688	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.03	□□□□□ -2.08
CS-233	ENST00000552688	MUC5AC	P98088	5654 aa		1.99	□□□□□ -2.09
CS-233	ENST00000552688	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		1.98	□□□□□ -2.09
CS-233	ENST00000552688	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		1.95	□□□□□ -2.1
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		1.95	□□□□□ -2.1
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		1.93	□□□□□ -2.1
CS-233	ENST00000552688	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.92	□□□□□ -2.1
CS-233	ENST00000552688	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	1.89	□□□□□ -2.11
CS-233	ENST00000552688	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		1.82	□□□□□ -2.12
CS-233	ENST00000552688	LCE1E	Q5T753	118 aa		1.81	□□□□□ -2.12
CS-233	ENST00000552688	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		1.76	□□□□□ -2.13
CS-233	ENST00000552688	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		1.68	□□□□□ -2.14
CS-233	ENST00000552688	LCE1C	Q5T751	118 aa		1.67	□□□□□ -2.14
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CS-233	ENST00000552688	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	1.49	□□□□□ -2.17
CS-233	ENST00000552688	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.47	□□□□□ -2.17
CS-233	ENST00000552688	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.35	□□□□□ -2.19
CS-233	ENST00000552688	PRM1	P04553	51 aa		1.27	□□□□□ -2.21
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.26	□□□□□ -2.21
CS-233	ENST00000552688	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.14	□□□□□ -2.23
CS-233	ENST00000552688	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.14	□□□□□ -2.23
CS-233	ENST00000552688	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.86	□□□□□ -2.27

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