RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CS-231	ENST00000552222	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CS-231	ENST00000552222	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CS-231	ENST00000552222	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CS-231	ENST00000552222	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CS-231	ENST00000552222	MT4	P47944	62 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CS-231	ENST00000552222	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CS-231	ENST00000552222	ROMO1	P60602	79 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CS-231	ENST00000552222	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CS-231	ENST00000552222	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-231	ENST00000552222	TNP1	P09430	55 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-231	ENST00000552222	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-231	ENST00000552222	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-231	ENST00000552222	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CS-231	ENST00000552222	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CS-231	ENST00000552222	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CS-231	ENST00000552222	MT1E	P04732	61 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CS-231	ENST00000552222	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CS-231	ENST00000552222	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CS-231	ENST00000552222	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5	□□□□□ -1.61
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-231	ENST00000552222	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-231	ENST00000552222	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-231	ENST00000552222	MT1M	Q8N339	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-231	ENST00000552222	MT1G	P13640	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-231	ENST00000552222	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-231	ENST00000552222	MT1L	Q93083	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CS-231	ENST00000552222	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-231	ENST00000552222	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-231	ENST00000552222	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-231	ENST00000552222	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CS-231	ENST00000552222	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CS-231	ENST00000552222	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CS-231	ENST00000552222	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CS-231	ENST00000552222	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CS-231	ENST00000552222	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CS-231	ENST00000552222	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CS-231	ENST00000552222	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CS-231	ENST00000552222	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CS-231	ENST00000552222	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CS-231	ENST00000552222	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CS-231	ENST00000552222	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CS-231	ENST00000552222	MT1A	P04731	61 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CS-231	ENST00000552222	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CS-231	ENST00000552222	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CS-231	ENST00000552222	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CS-231	ENST00000552222	MT3	P25713	68 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CS-231	ENST00000552222		H3BS24	57 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CS-231	ENST00000552222		A0A0A0MQY5	61 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CS-231	ENST00000552222	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CS-231	ENST00000552222	INE1	O15225	51 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CS-231	ENST00000552222	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CS-231	ENST00000552222	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CS-231	ENST00000552222	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.23	□□□□□ -1.89
CS-231	ENST00000552222	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CS-231	ENST00000552222	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CS-231	ENST00000552222	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CS-231	ENST00000552222	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
CS-231	ENST00000552222	PRM1	P04553	51 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CS-231	ENST00000552222	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CS-231	ENST00000552222	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CS-231	ENST00000552222	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CS-231	ENST00000552222	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.33	□□□□□ -2.04
CS-231	ENST00000552222	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.81	□□□□□ -2.12

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms