RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 K7ERS5 55 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 SPRR2EP22531 72 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 SPRR2BP35325 72 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 SPRR2AP35326 72 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 TNP1P09430 55 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-224ENST00000551155 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-224ENST00000551155 A6NED7 52 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-224ENST00000551155 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-224ENST00000551155 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-224ENST00000551155 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 NEBP20929 6669 aa3.48□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 MDN1Q9NU22 5596 aa3.48□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 SPRR2DP22532 72 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-224ENST00000551155 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 MT1EP04732 61 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 LCE3AQ5TA76 89 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 LCE1EQ5T753 118 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-224ENST00000551155 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-224ENST00000551155 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-224ENST00000551155 MT1GP13640 62 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-224ENST00000551155 PP632Q6XCG6 107 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-224ENST00000551155 KRTAP12-3P60328 96 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-224ENST00000551155 ROMO1P60602 79 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-224ENST00000551155 MT1LQ93083 61 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-224ENST00000551155 MT1MQ8N339 61 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-224ENST00000551155 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-224ENST00000551155 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CS-224ENST00000551155 BRK1Q8WUW1 75 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.16□□□□□ -1.9
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.14□□□□□ -1.91
CS-224ENST00000551155 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.1□□□□□ -1.91
CS-224ENST00000551155 PMAIP1Q13794 54 aa3.06□□□□□ -1.92
CS-224ENST00000551155 MT4P47944 62 aa3.01□□□□□ -1.93
CS-224ENST00000551155 MT3P25713 68 aa3□□□□□ -1.93
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CS-224ENST00000551155 PRO0628Q9UI54 55 aa2.96□□□□□ -1.94
CS-224ENST00000551155 KRTAP12-4P60329 112 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-224ENST00000551155 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-224ENST00000551155 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-224ENST00000551155 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.85□□□□□ -1.95
CS-224ENST00000551155 MT1AP04731 61 aa2.85□□□□□ -1.95
CS-224ENST00000551155 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.85□□□□□ -1.95
CS-224ENST00000551155 PRAC1Q96KF2 57 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-224ENST00000551155 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-224ENST00000551155 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-224ENST00000551155 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-8O75690 187 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-224ENST00000551155 LCE1FQ5T754 118 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-224ENST00000551155 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-224ENST00000551155 SVIPQ8NHG7 77 aa2.66□□□□□ -1.98
CS-224ENST00000551155 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-224ENST00000551155 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-224ENST00000551155 A0A0A0MQY5 61 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-224ENST00000551155 LUZP6Q538Z0 58 aa2.47□□□□□ -2.01
CS-224ENST00000551155 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.38□□□□□ -2.03
CS-224ENST00000551155 NDUFAF8A1L188 74 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-224ENST00000551155 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-224ENST00000551155 LCE1CQ5T751 118 aa2.2□□□□□ -2.06
CS-224ENST00000551155 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.2□□□□□ -2.06
CS-224ENST00000551155 MUC5ACP98088 5654 aa2.17□□□□□ -2.06
CS-224ENST00000551155 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CS-224ENST00000551155 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
CS-224ENST00000551155 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.99□□□□□ -2.09
CS-224ENST00000551155 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-224ENST00000551155 INE1O15225 51 aa1.74□□□□□ -2.13
CS-224ENST00000551155 PRM1P04553 51 aa1.7□□□□□ -2.14
CS-224ENST00000551155 PHGR1C9JFL3 82 aa1.69□□□□□ -2.14
CS-224ENST00000551155 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.22□□□□□ -2.21
CS-224ENST00000551155 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
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