RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-222ENST00000550996 PRR15LQ9BU68 103 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-222ENST00000550996 TMEM258P61165 79 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-222ENST00000550996 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-222ENST00000550996 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-222ENST00000550996 LCE3AQ5TA76 89 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-222ENST00000550996 TNP1P09430 55 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-222ENST00000550996 MT1GP13640 62 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-222ENST00000550996 MT1LQ93083 61 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-222ENST00000550996 UQCR11O14957 56 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-222ENST00000550996 MT1MQ8N339 61 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-222ENST00000550996 PP632Q6XCG6 107 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-222ENST00000550996 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-222ENST00000550996 PSPHP1O15172 72 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-222ENST00000550996 KRTAP12-3P60328 96 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-222ENST00000550996 Q1T7F1 81 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-222ENST00000550996 H3BS24 57 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-222ENST00000550996 V9GYY9 64 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-222ENST00000550996 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-222ENST00000550996 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-222ENST00000550996 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-222ENST00000550996 K7ERS5 55 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-222ENST00000550996 MT4P47944 62 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-222ENST00000550996 A6NED7 52 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-222ENST00000550996 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-222ENST00000550996 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-222ENST00000550996 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-222ENST00000550996 PCP4P48539 62 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-222ENST00000550996 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-222ENST00000550996 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-222ENST00000550996 ROMO1P60602 79 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-222ENST00000550996 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-222ENST00000550996 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-222ENST00000550996 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-222ENST00000550996 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-222ENST00000550996 KRTAP12-4P60329 112 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-222ENST00000550996 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-222ENST00000550996 MT1AP04731 61 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-222ENST00000550996 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-222ENST00000550996 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-222ENST00000550996 BRK1Q8WUW1 75 aa6□□□□□ -1.45
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-8O75690 187 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CS-222ENST00000550996 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-222ENST00000550996 MT3P25713 68 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-222ENST00000550996 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
CS-222ENST00000550996 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-222ENST00000550996 PMAIP1Q13794 54 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-222ENST00000550996 MUC5ACP98088 5654 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-222ENST00000550996 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-222ENST00000550996 PRAC1Q96KF2 57 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-222ENST00000550996 LCE1EQ5T753 118 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-222ENST00000550996 PRO0628Q9UI54 55 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-222ENST00000550996 SVIPQ8NHG7 77 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-222ENST00000550996 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-222ENST00000550996 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-222ENST00000550996 LCE1CQ5T751 118 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-222ENST00000550996 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-222ENST00000550996 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-222ENST00000550996 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-222ENST00000550996 LUZP6Q538Z0 58 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-222ENST00000550996 LCE1FQ5T754 118 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-222ENST00000550996 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-222ENST00000550996 A0A0A0MQY5 61 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-222ENST00000550996 PHGR1C9JFL3 82 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-222ENST00000550996 NDUFAF8A1L188 74 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-222ENST00000550996 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-222ENST00000550996 PRM1P04553 51 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-222ENST00000550996 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.87□□□□□ -1.95
CS-222ENST00000550996 INE1O15225 51 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-222ENST00000550996 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms