RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDB1-223	ENST00000543658	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDB1-223	ENST00000543658	KMT2D	O14686	5537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDB1-223	ENST00000543658	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDB1-223	ENST00000543658	NEB	P20929	6669 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0A0MQY5	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.51	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.5	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.49	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.48	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.47	□□□□□ -1.69
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.44	□□□□□ -1.7
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.4	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	MT1E	P04732	61 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR2E	P22531	72 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR2B	P35325	72 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR2A	P35326	72 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.34	□□□□□ -1.71
DDB1-223	ENST00000543658	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.28	□□□□□ -1.72
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.27	□□□□□ -1.73
DDB1-223	ENST00000543658	MT1L	Q93083	61 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DDB1-223	ENST00000543658	MT1G	P13640	62 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR2D	P22532	72 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DDB1-223	ENST00000543658	MT1M	Q8N339	61 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DDB1-223	ENST00000543658	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DDB1-223	ENST00000543658	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4	□□□□□ -1.77
DDB1-223	ENST00000543658	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
DDB1-223	ENST00000543658	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.93	□□□□□ -1.78
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.92	□□□□□ -1.78
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.89	□□□□□ -1.79
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.8	□□□□□ -1.8
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DDB1-223	ENST00000543658	MT4	P47944	62 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DDB1-223	ENST00000543658	MT1A	P04731	61 aa		3.63	□□□□□ -1.83
DDB1-223	ENST00000543658	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.62	□□□□□ -1.83
DDB1-223	ENST00000543658	MT3	P25713	68 aa		3.61	□□□□□ -1.83
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.6	□□□□□ -1.83
DDB1-223	ENST00000543658	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.6	□□□□□ -1.83
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.57	□□□□□ -1.84
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.47	□□□□□ -1.85
DDB1-223	ENST00000543658	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
DDB1-223	ENST00000543658	INE1	O15225	51 aa		3.4	□□□□□ -1.87
DDB1-223	ENST00000543658	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.34	□□□□□ -1.87
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.28	□□□□□ -1.88
DDB1-223	ENST00000543658	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
DDB1-223	ENST00000543658	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DDB1-223	ENST00000543658	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
DDB1-223	ENST00000543658	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.05	□□□□□ -1.92
DDB1-223	ENST00000543658	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.03	□□□□□ -1.92
DDB1-223	ENST00000543658	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DDB1-223	ENST00000543658	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.94	□□□□□ -1.94
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.93	□□□□□ -1.94
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.87	□□□□□ -1.95
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
DDB1-223	ENST00000543658	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.77	□□□□□ -1.97
DDB1-223	ENST00000543658	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.71	□□□□□ -1.98
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.43	□□□□□ -2.02
DDB1-223	ENST00000543658	PRM1	P04553	51 aa		2.42	□□□□□ -2.02
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.31	□□□□□ -2.04
DDB1-223	ENST00000543658	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.1	□□□□□ -2.07
DDB1-223	ENST00000543658	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.79	□□□□□ -2.12
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.56	□□□□□ -2.16
DDB1-223	ENST00000543658	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.33	□□□□□ -2.2

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