RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-202ENST00000542324 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-202ENST00000542324 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.84□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.84□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 LCE3BQ5TA77 95 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-202ENST00000542324 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-202ENST00000542324 KMT2DO14686 5537 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-202ENST00000542324 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.65□□□□□ -1.82
CS-202ENST00000542324 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-202ENST00000542324 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-202ENST00000542324 MT1LQ93083 61 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-202ENST00000542324 LCE1DQ5T752 114 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-202ENST00000542324 MT1EP04732 61 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.51□□□□□ -1.85
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-202ENST00000542324 MDN1Q9NU22 5596 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-202ENST00000542324 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CS-202ENST00000542324 MT1GP13640 62 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-202ENST00000542324 MT1MQ8N339 61 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-202ENST00000542324 KRTAP12-4P60329 112 aa3.29□□□□□ -1.88
CS-202ENST00000542324 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-9P26371 169 aa3.24□□□□□ -1.89
CS-202ENST00000542324 LCE4AQ5TA78 99 aa3.23□□□□□ -1.89
CS-202ENST00000542324 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CS-202ENST00000542324 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.2□□□□□ -1.9
CS-202ENST00000542324 MT1AP04731 61 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-202ENST00000542324 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-202ENST00000542324 SPRR2EP22531 72 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-202ENST00000542324 SPRR2BP35325 72 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-202ENST00000542324 SPRR2AP35326 72 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-202ENST00000542324 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.05□□□□□ -1.92
CS-202ENST00000542324 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-202ENST00000542324 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-202ENST00000542324 SPRR2DP22532 72 aa3.01□□□□□ -1.93
CS-202ENST00000542324 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.01□□□□□ -1.93
CS-202ENST00000542324 MUC5ACP98088 5654 aa3□□□□□ -1.93
CS-202ENST00000542324 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.99□□□□□ -1.93
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
CS-202ENST00000542324 PRM1P04553 51 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-202ENST00000542324 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
CS-202ENST00000542324 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.81□□□□□ -1.96
CS-202ENST00000542324 MT3P25713 68 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-202ENST00000542324 MT4P47944 62 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-8O75690 187 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-202ENST00000542324 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.4□□□□□ -2.03
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.39□□□□□ -2.03
CS-202ENST00000542324 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.38□□□□□ -2.03
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-202ENST00000542324 LCE1EQ5T753 118 aa2.22□□□□□ -2.05
CS-202ENST00000542324 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-202ENST00000542324 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.08□□□□□ -2.08
CS-202ENST00000542324 LCE1CQ5T751 118 aa2.07□□□□□ -2.08
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-202ENST00000542324 LCE1FQ5T754 118 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-202ENST00000542324 PHGR1C9JFL3 82 aa2.03□□□□□ -2.09
CS-202ENST00000542324 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.96□□□□□ -2.1
CS-202ENST00000542324 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.92□□□□□ -2.1
CS-202ENST00000542324 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.52□□□□□ -2.17
CS-202ENST00000542324 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.8 ms