RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.21□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE1DQ5T752 114 aa4.21□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 MT1MQ8N339 61 aa4.21□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 MT1LQ93083 61 aa4.2□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 A8MU10 97 aa4.16□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 PP632Q6XCG6 107 aa4.16□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.16□□□□□ -1.74
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE4AQ5TA78 99 aa4.15□□□□□ -1.75
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.15□□□□□ -1.75
CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-211ENST00000541667 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.14□□□□□ -1.75
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CLSTN3-211ENST00000541667 LCE3AQ5TA76 89 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-211ENST00000541667 BRK1Q8WUW1 75 aa4.09□□□□□ -1.75
CLSTN3-211ENST00000541667 K7ERS5 55 aa4.06□□□□□ -1.76
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.06□□□□□ -1.76
CLSTN3-211ENST00000541667 TNP1P09430 55 aa4.04□□□□□ -1.76
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.03□□□□□ -1.76
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CLSTN3-211ENST00000541667 SVIPQ8NHG7 77 aa4□□□□□ -1.77
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CLSTN3-211ENST00000541667 PRO0628Q9UI54 55 aa3.95□□□□□ -1.78
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CLSTN3-211ENST00000541667 ROMO1P60602 79 aa3.87□□□□□ -1.79
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CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.84□□□□□ -1.79
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.82□□□□□ -1.8
CLSTN3-211ENST00000541667 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.82□□□□□ -1.8
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CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.72□□□□□ -1.81
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CLSTN3-211ENST00000541667 MT1AP04731 61 aa3.56□□□□□ -1.84
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.56□□□□□ -1.84
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.51□□□□□ -1.85
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CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP5-8O75690 187 aa3.47□□□□□ -1.85
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.42□□□□□ -1.86
CLSTN3-211ENST00000541667 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.35□□□□□ -1.87
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CLSTN3-211ENST00000541667 H3BS24 57 aa2.71□□□□□ -1.98
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.66□□□□□ -1.98
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.58□□□□□ -2
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.56□□□□□ -2
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0A0MQY5 61 aa2.52□□□□□ -2.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE1FQ5T754 118 aa2.51□□□□□ -2.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.41□□□□□ -2.02
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.38□□□□□ -2.03
CLSTN3-211ENST00000541667 INE1O15225 51 aa2.37□□□□□ -2.03
CLSTN3-211ENST00000541667 PHGR1C9JFL3 82 aa2.28□□□□□ -2.04
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.17□□□□□ -2.06
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.07□□□□□ -2.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PRM1P04553 51 aa2□□□□□ -2.09
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.73□□□□□ -2.13
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.43□□□□□ -2.18
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