RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 K7ERS5 55 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.25□□□□□ -1.41
ZBED1-205ENST00000515319 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.23□□□□□ -1.41
ZBED1-205ENST00000515319 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.21□□□□□ -1.42
ZBED1-205ENST00000515319 LCE1DQ5T752 114 aa6.18□□□□□ -1.42
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ZBED1-205ENST00000515319 ROMO1P60602 79 aa6.15□□□□□ -1.42
ZBED1-205ENST00000515319 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.13□□□□□ -1.43
ZBED1-205ENST00000515319 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.13□□□□□ -1.43
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP10-12P60413 245 aa6.12□□□□□ -1.43
ZBED1-205ENST00000515319 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.12□□□□□ -1.43
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.09□□□□□ -1.43
ZBED1-205ENST00000515319 MT4P47944 62 aa6.04□□□□□ -1.44
ZBED1-205ENST00000515319 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.02□□□□□ -1.45
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.99□□□□□ -1.45
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.99□□□□□ -1.45
ZBED1-205ENST00000515319 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.98□□□□□ -1.45
ZBED1-205ENST00000515319 LCE4AQ5TA78 99 aa5.96□□□□□ -1.46
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED1-205ENST00000515319 PRAC1Q96KF2 57 aa5.95□□□□□ -1.46
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.92□□□□□ -1.46
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.88□□□□□ -1.47
ZBED1-205ENST00000515319 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.84□□□□□ -1.47
ZBED1-205ENST00000515319 TNP1P09430 55 aa5.81□□□□□ -1.48
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.79□□□□□ -1.48
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.78□□□□□ -1.48
ZBED1-205ENST00000515319 MT1EP04732 61 aa5.77□□□□□ -1.49
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.77□□□□□ -1.49
ZBED1-205ENST00000515319 PP632Q6XCG6 107 aa5.75□□□□□ -1.49
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.69□□□□□ -1.5
ZBED1-205ENST00000515319 MT1GP13640 62 aa5.65□□□□□ -1.5
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.64□□□□□ -1.51
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.57□□□□□ -1.52
ZBED1-205ENST00000515319 LCE3AQ5TA76 89 aa5.56□□□□□ -1.52
ZBED1-205ENST00000515319 MT1MQ8N339 61 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.45□□□□□ -1.54
ZBED1-205ENST00000515319 MT1LQ93083 61 aa5.39□□□□□ -1.55
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.39□□□□□ -1.55
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.39□□□□□ -1.55
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP12-3P60328 96 aa5.38□□□□□ -1.55
ZBED1-205ENST00000515319 A0A0A0MQY5 61 aa5.36□□□□□ -1.55
ZBED1-205ENST00000515319 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.26□□□□□ -1.57
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP12-4P60329 112 aa5.23□□□□□ -1.57
ZBED1-205ENST00000515319 MUC5ACP98088 5654 aa5.19□□□□□ -1.58
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ZBED1-205ENST00000515319 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ZBED1-205ENST00000515319 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-8O75690 187 aa5.03□□□□□ -1.6
ZBED1-205ENST00000515319 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.01□□□□□ -1.61
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.86□□□□□ -1.63
ZBED1-205ENST00000515319 LUZP6Q538Z0 58 aa4.85□□□□□ -1.63
ZBED1-205ENST00000515319 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.75□□□□□ -1.65
ZBED1-205ENST00000515319 NDUFAF8A1L188 74 aa4.75□□□□□ -1.65
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.74□□□□□ -1.65
ZBED1-205ENST00000515319 MT1AP04731 61 aa4.6□□□□□ -1.67
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.6□□□□□ -1.67
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.55□□□□□ -1.68
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.49□□□□□ -1.69
ZBED1-205ENST00000515319 MT3P25713 68 aa4.23□□□□□ -1.73
ZBED1-205ENST00000515319 LCE1EQ5T753 118 aa4.03□□□□□ -1.76
ZBED1-205ENST00000515319 INE1O15225 51 aa4.02□□□□□ -1.77
ZBED1-205ENST00000515319 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.91□□□□□ -1.78
ZBED1-205ENST00000515319 LCE1CQ5T751 118 aa3.75□□□□□ -1.81
ZBED1-205ENST00000515319 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.74□□□□□ -1.81
ZBED1-205ENST00000515319 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.66□□□□□ -1.82
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.65□□□□□ -1.83
ZBED1-205ENST00000515319 PHGR1C9JFL3 82 aa3.61□□□□□ -1.83
ZBED1-205ENST00000515319 LCE1FQ5T754 118 aa3.55□□□□□ -1.84
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ZBED1-205ENST00000515319 PRM1P04553 51 aa3.18□□□□□ -1.9
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED1-205ENST00000515319 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.99□□□□□ -1.93
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.96□□□□□ -1.94
ZBED1-205ENST00000515319 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.74□□□□□ -1.97
ZBED1-205ENST00000515319 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.8 ms