RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.23□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 A0A0D9SG42 100 aa3.22□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 LCE3AQ5TA76 89 aa3.22□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.22□□□□□ -1.89
HERC3-210ENST00000512194 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.21□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 A6NN06 94 aa3.2□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.2□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 LUZP6Q538Z0 58 aa3.2□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 PLAC4Q8WY50 150 aa3.2□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.19□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 BRK1Q8WUW1 75 aa3.19□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.18□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 MDN1Q9NU22 5596 aa3.17□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.17□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 KMT2DO14686 5537 aa3.16□□□□□ -1.9
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP12-1P59990 96 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-210ENST00000512194 PRO0628Q9UI54 55 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-210ENST00000512194 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 MT1BP07438 61 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-9P26371 169 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 PMAIP1Q13794 54 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 PP632Q6XCG6 107 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-210ENST00000512194 ROMO1P60602 79 aa3□□□□□ -1.93
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
HERC3-210ENST00000512194 TNP1P09430 55 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-210ENST00000512194 MT1XP80297 61 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-210ENST00000512194 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-210ENST00000512194 SPRR2EP22531 72 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-210ENST00000512194 SPRR2BP35325 72 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-210ENST00000512194 SPRR2AP35326 72 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-210ENST00000512194 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.88□□□□□ -1.95
HERC3-210ENST00000512194 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-210ENST00000512194 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-210ENST00000512194 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
HERC3-210ENST00000512194 SPRR2DP22532 72 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-210ENST00000512194 LCE1CQ5T751 118 aa2.79□□□□□ -1.96
HERC3-210ENST00000512194 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.79□□□□□ -1.96
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.77□□□□□ -1.97
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.76□□□□□ -1.97
HERC3-210ENST00000512194 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.71□□□□□ -1.98
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP12-3P60328 96 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-210ENST00000512194 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.63□□□□□ -1.99
HERC3-210ENST00000512194 MT1EP04732 61 aa2.61□□□□□ -1.99
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.58□□□□□ -2
HERC3-210ENST00000512194 MT1GP13640 62 aa2.55□□□□□ -2
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.55□□□□□ -2
HERC3-210ENST00000512194 MT1LQ93083 61 aa2.55□□□□□ -2
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-210ENST00000512194 MT4P47944 62 aa2.5□□□□□ -2.01
HERC3-210ENST00000512194 MT1MQ8N339 61 aa2.47□□□□□ -2.01
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP12-4P60329 112 aa2.42□□□□□ -2.02
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.42□□□□□ -2.02
HERC3-210ENST00000512194 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-210ENST00000512194 MUC5ACP98088 5654 aa2.24□□□□□ -2.05
HERC3-210ENST00000512194 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
HERC3-210ENST00000512194 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.21□□□□□ -2.06
HERC3-210ENST00000512194 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
HERC3-210ENST00000512194 MT1AP04731 61 aa2.18□□□□□ -2.06
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-8O75690 187 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.99□□□□□ -2.09
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.93□□□□□ -2.1
HERC3-210ENST00000512194 INE1O15225 51 aa1.88□□□□□ -2.11
HERC3-210ENST00000512194 PRM1P04553 51 aa1.53□□□□□ -2.16
HERC3-210ENST00000512194 PHGR1C9JFL3 82 aa1.49□□□□□ -2.17
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.11□□□□□ -2.23
HERC3-210ENST00000512194 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.08□□□□□ -2.24
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