RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SH3BP2-223	ENST00000512131		K7ERS5	55 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SH3BP2-223	ENST00000512131		A6NED7	52 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT1G	P13640	62 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT1L	Q93083	61 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT1M	Q8N339	61 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT4	P47944	62 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6	□□□□□ -1.45
SH3BP2-223	ENST00000512131	ROMO1	P60602	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.54	□□□□□ -1.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SH3BP2-223	ENST00000512131	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SH3BP2-223	ENST00000512131	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT1A	P04731	61 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SH3BP2-223	ENST00000512131	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT3	P25713	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SH3BP2-223	ENST00000512131	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRM1	P04553	51 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0A0MQY5	61 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BS24	57 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SH3BP2-223	ENST00000512131	INE1	O15225	51 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SH3BP2-223	ENST00000512131	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.16	□□□□□ -2.06

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