RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.68□□□□□ -1.34
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.66□□□□□ -1.34
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.66□□□□□ -1.34
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.66□□□□□ -1.34
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE3AQ5TA76 89 aa6.65□□□□□ -1.34
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.56□□□□□ -1.36
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.54□□□□□ -1.36
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.54□□□□□ -1.36
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE4AQ5TA78 99 aa6.49□□□□□ -1.37
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.46□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.46□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.46□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE1DQ5T752 114 aa6.44□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT1LQ93083 61 aa6.43□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT1GP13640 62 aa6.42□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP12-3P60328 96 aa6.4□□□□□ -1.38
RASGEF1B-205ENST00000507538 PP632Q6XCG6 107 aa6.37□□□□□ -1.39
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT1MQ8N339 61 aa6.34□□□□□ -1.39
RASGEF1B-205ENST00000507538 ROMO1P60602 79 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.32□□□□□ -1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.29□□□□□ -1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.23□□□□□ -1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.17□□□□□ -1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 BRK1Q8WUW1 75 aa6.07□□□□□ -1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.06□□□□□ -1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.05□□□□□ -1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.03□□□□□ -1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.91□□□□□ -1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.87□□□□□ -1.47
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT4P47944 62 aa5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RASGEF1B-205ENST00000507538 PMAIP1Q13794 54 aa5.71□□□□□ -1.5
RASGEF1B-205ENST00000507538 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.68□□□□□ -1.5
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.58□□□□□ -1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP12-4P60329 112 aa5.55□□□□□ -1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRO0628Q9UI54 55 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.52□□□□□ -1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT1AP04731 61 aa5.48□□□□□ -1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRAC1Q96KF2 57 aa5.46□□□□□ -1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.42□□□□□ -1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.37□□□□□ -1.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.34□□□□□ -1.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.29□□□□□ -1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.23□□□□□ -1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.2□□□□□ -1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 MT3P25713 68 aa4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 SVIPQ8NHG7 77 aa4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-8O75690 187 aa4.8□□□□□ -1.64
RASGEF1B-205ENST00000507538 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.62□□□□□ -1.67
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.6□□□□□ -1.67
RASGEF1B-205ENST00000507538 LUZP6Q538Z0 58 aa4.55□□□□□ -1.68
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE1EQ5T753 118 aa4.51□□□□□ -1.69
RASGEF1B-205ENST00000507538 MUC5ACP98088 5654 aa4.44□□□□□ -1.7
RASGEF1B-205ENST00000507538 A0A0A0MQY5 61 aa4.43□□□□□ -1.7
RASGEF1B-205ENST00000507538 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
RASGEF1B-205ENST00000507538 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.31□□□□□ -1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.23□□□□□ -1.73
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE1CQ5T751 118 aa4.18□□□□□ -1.74
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.08□□□□□ -1.76
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 NDUFAF8A1L188 74 aa3.91□□□□□ -1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 LCE1FQ5T754 118 aa3.86□□□□□ -1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.57□□□□□ -1.84
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.3□□□□□ -1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 PHGR1C9JFL3 82 aa3.25□□□□□ -1.89
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRM1P04553 51 aa3.25□□□□□ -1.89
RASGEF1B-205ENST00000507538 INE1O15225 51 aa3.18□□□□□ -1.9
RASGEF1B-205ENST00000507538 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1B-205ENST00000507538 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.32□□□□□ -2.04
RASGEF1B-205ENST00000507538 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.08□□□□□ -2.08
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