RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFAF8A1L188 74 aa4.02□□□□□ -1.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR2EP22531 72 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR2BP35325 72 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR2AP35326 72 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0A0MQY5 61 aa3.94□□□□□ -1.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LUZP6Q538Z0 58 aa3.93□□□□□ -1.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.89□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.89□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR2DP22532 72 aa3.88□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1EP04732 61 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.86□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1LQ93083 61 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE3BQ5TA77 95 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.7□□□□□ -1.82
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.67□□□□□ -1.82
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1GP13640 62 aa3.65□□□□□ -1.83
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1MQ8N339 61 aa3.63□□□□□ -1.83
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.6□□□□□ -1.83
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.59□□□□□ -1.83
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-209ENST00000504450 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.48□□□□□ -1.85
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE1DQ5T752 114 aa3.45□□□□□ -1.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MT4P47944 62 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE4AQ5TA78 99 aa3.36□□□□□ -1.87
SH3BP2-209ENST00000504450 INE1O15225 51 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP2-209ENST00000504450 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP2-209ENST00000504450 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.31□□□□□ -1.88
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.28□□□□□ -1.88
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.27□□□□□ -1.89
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1AP04731 61 aa3.25□□□□□ -1.89
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.22□□□□□ -1.89
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.22□□□□□ -1.89
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.17□□□□□ -1.9
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.16□□□□□ -1.9
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.1□□□□□ -1.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.08□□□□□ -1.92
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP12-4P60329 112 aa3.03□□□□□ -1.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MT3P25713 68 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.87□□□□□ -1.95
SH3BP2-209ENST00000504450 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.86□□□□□ -1.95
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.8□□□□□ -1.96
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC5ACP98088 5654 aa2.79□□□□□ -1.96
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-8O75690 187 aa2.79□□□□□ -1.96
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.7□□□□□ -1.98
SH3BP2-209ENST00000504450 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.68□□□□□ -1.98
SH3BP2-209ENST00000504450 PRM1P04553 51 aa2.57□□□□□ -2
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.55□□□□□ -2
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE1EQ5T753 118 aa2.5□□□□□ -2.01
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.35□□□□□ -2.03
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.34□□□□□ -2.03
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE1CQ5T751 118 aa2.33□□□□□ -2.04
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.2□□□□□ -2.06
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.12□□□□□ -2.07
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.04□□□□□ -2.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PHGR1C9JFL3 82 aa1.97□□□□□ -2.09
SH3BP2-209ENST00000504450 LCE1FQ5T754 118 aa1.97□□□□□ -2.09
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.84□□□□□ -2.11
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.67□□□□□ -2.14
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.64□□□□□ -2.15
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
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