RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.68□□□□□ -1.02
SIMC1-208ENST00000495423 LCE1DQ5T752 114 aa8.67□□□□□ -1.02
SIMC1-208ENST00000495423 TNP1P09430 55 aa8.64□□□□□ -1.03
SIMC1-208ENST00000495423 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.64□□□□□ -1.03
SIMC1-208ENST00000495423 MT1EP04732 61 aa8.63□□□□□ -1.03
SIMC1-208ENST00000495423 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.54□□□□□ -1.04
SIMC1-208ENST00000495423 LCE4AQ5TA78 99 aa8.51□□□□□ -1.05
SIMC1-208ENST00000495423 MT4P47944 62 aa8.46□□□□□ -1.06
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.45□□□□□ -1.06
SIMC1-208ENST00000495423 MT1GP13640 62 aa8.42□□□□□ -1.06
SIMC1-208ENST00000495423 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa8.41□□□□□ -1.06
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa8.39□□□□□ -1.07
SIMC1-208ENST00000495423 PP632Q6XCG6 107 aa8.33□□□□□ -1.08
SIMC1-208ENST00000495423 LCE3AQ5TA76 89 aa8.31□□□□□ -1.08
SIMC1-208ENST00000495423 ROMO1P60602 79 aa8.27□□□□□ -1.09
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.27□□□□□ -1.09
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.27□□□□□ -1.09
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.26□□□□□ -1.09
SIMC1-208ENST00000495423 MT1MQ8N339 61 aa8.26□□□□□ -1.09
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.18□□□□□ -1.1
SIMC1-208ENST00000495423 BRK1Q8WUW1 75 aa8.17□□□□□ -1.1
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa8.15□□□□□ -1.1
SIMC1-208ENST00000495423 MT1LQ93083 61 aa8.14□□□□□ -1.11
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP12-3P60328 96 aa8.06□□□□□ -1.12
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.06□□□□□ -1.12
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.04□□□□□ -1.12
SIMC1-208ENST00000495423 SVIPQ8NHG7 77 aa7.9□□□□□ -1.14
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.88□□□□□ -1.15
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.82□□□□□ -1.16
SIMC1-208ENST00000495423 PMAIP1Q13794 54 aa7.75□□□□□ -1.17
SIMC1-208ENST00000495423 H3BS24 57 aa7.74□□□□□ -1.17
SIMC1-208ENST00000495423 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.73□□□□□ -1.17
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.73□□□□□ -1.17
SIMC1-208ENST00000495423 PRO0628Q9UI54 55 aa7.7□□□□□ -1.18
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.69□□□□□ -1.18
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP12-4P60329 112 aa7.57□□□□□ -1.2
SIMC1-208ENST00000495423 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.48□□□□□ -1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SIMC1-208ENST00000495423 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.31□□□□□ -1.24
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.29□□□□□ -1.24
SIMC1-208ENST00000495423 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.22□□□□□ -1.25
SIMC1-208ENST00000495423 PRAC1Q96KF2 57 aa7.22□□□□□ -1.25
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.14□□□□□ -1.27
SIMC1-208ENST00000495423 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SIMC1-208ENST00000495423 MUC5ACP98088 5654 aa7.07□□□□□ -1.28
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-8O75690 187 aa7.07□□□□□ -1.28
SIMC1-208ENST00000495423 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.96□□□□□ -1.3
SIMC1-208ENST00000495423 MT1AP04731 61 aa6.92□□□□□ -1.3
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.91□□□□□ -1.3
SIMC1-208ENST00000495423 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.8□□□□□ -1.32
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.79□□□□□ -1.32
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.75□□□□□ -1.33
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.72□□□□□ -1.33
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.5□□□□□ -1.37
SIMC1-208ENST00000495423 MT3P25713 68 aa6.35□□□□□ -1.39
SIMC1-208ENST00000495423 A0A0A0MQY5 61 aa6.3□□□□□ -1.4
SIMC1-208ENST00000495423 LUZP6Q538Z0 58 aa6.18□□□□□ -1.42
SIMC1-208ENST00000495423 LCE1EQ5T753 118 aa6.01□□□□□ -1.45
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.95□□□□□ -1.46
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.73□□□□□ -1.49
SIMC1-208ENST00000495423 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.65□□□□□ -1.5
SIMC1-208ENST00000495423 LCE1CQ5T751 118 aa5.57□□□□□ -1.52
SIMC1-208ENST00000495423 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.51□□□□□ -1.53
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFAF8A1L188 74 aa5.37□□□□□ -1.55
SIMC1-208ENST00000495423 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.28□□□□□ -1.56
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.17□□□□□ -1.58
SIMC1-208ENST00000495423 LCE1FQ5T754 118 aa5.12□□□□□ -1.59
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SIMC1-208ENST00000495423 PHGR1C9JFL3 82 aa4.89□□□□□ -1.63
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.58□□□□□ -1.68
SIMC1-208ENST00000495423 INE1O15225 51 aa4.56□□□□□ -1.68
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.24□□□□□ -1.73
SIMC1-208ENST00000495423 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.24□□□□□ -1.73
SIMC1-208ENST00000495423 PRM1P04553 51 aa4.2□□□□□ -1.74
SIMC1-208ENST00000495423 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.73□□□□□ -1.81
SIMC1-208ENST00000495423 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.93□□□□□ -1.94
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