RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491166.1

TMCO3-208, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, human

TSL 2

Gene TMCO3, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMCO3-208	ENST00000491166	MT1E	P04732	61 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMCO3-208	ENST00000491166		Q1T7F1	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMCO3-208	ENST00000491166	PSPHP1	O15172	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMCO3-208	ENST00000491166	UQCR11	O14957	56 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMCO3-208	ENST00000491166	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMCO3-208	ENST00000491166		V9GYY9	64 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMCO3-208	ENST00000491166	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMCO3-208	ENST00000491166	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TMCO3-208	ENST00000491166	MT1G	P13640	62 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TMCO3-208	ENST00000491166	MT1L	Q93083	61 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TMCO3-208	ENST00000491166	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TMCO3-208	ENST00000491166	MT1M	Q8N339	61 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TMCO3-208	ENST00000491166	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TMCO3-208	ENST00000491166	TNP1	P09430	55 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TMCO3-208	ENST00000491166	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TMCO3-208	ENST00000491166		A6NED7	52 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMCO3-208	ENST00000491166	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TMCO3-208	ENST00000491166		K7ERS5	55 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TMCO3-208	ENST00000491166	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TMCO3-208	ENST00000491166	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TMCO3-208	ENST00000491166	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TMCO3-208	ENST00000491166	ROMO1	P60602	79 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TMCO3-208	ENST00000491166	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TMCO3-208	ENST00000491166	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TMCO3-208	ENST00000491166	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TMCO3-208	ENST00000491166	MT1A	P04731	61 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TMCO3-208	ENST00000491166	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TMCO3-208	ENST00000491166		H3BS24	57 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TMCO3-208	ENST00000491166	MT3	P25713	68 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TMCO3-208	ENST00000491166	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TMCO3-208	ENST00000491166	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TMCO3-208	ENST00000491166		A0A0A0MQY5	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TMCO3-208	ENST00000491166	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TMCO3-208	ENST00000491166	INE1	O15225	51 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TMCO3-208	ENST00000491166	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TMCO3-208	ENST00000491166	PRM1	P04553	51 aa		2.15	□□□□□ -2.07
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TMCO3-208	ENST00000491166	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.53	□□□□□ -2.16

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms