RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484031.5

TRO-222, Transcript of trophinin, human

TSL 5

Gene TRO, Length 650 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRO-222	ENST00000484031	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRO-222	ENST00000484031	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRO-222	ENST00000484031	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRO-222	ENST00000484031		A8MU10	97 aa		5	□□□□□ -1.61
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5	□□□□□ -1.61
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031		A0A0A0MQY5	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031	PSPHP1	O15172	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031		V9GYY9	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031	MT1E	P04732	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031		Q1T7F1	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRO-222	ENST00000484031	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRO-222	ENST00000484031	UQCR11	O14957	56 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRO-222	ENST00000484031	MT1G	P13640	62 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRO-222	ENST00000484031		A6NED7	52 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRO-222	ENST00000484031	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRO-222	ENST00000484031	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRO-222	ENST00000484031	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRO-222	ENST00000484031	TNP1	P09430	55 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRO-222	ENST00000484031	MT1M	Q8N339	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRO-222	ENST00000484031	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRO-222	ENST00000484031	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRO-222	ENST00000484031	MT1L	Q93083	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRO-222	ENST00000484031		K7ERS5	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRO-222	ENST00000484031	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRO-222	ENST00000484031	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TRO-222	ENST00000484031	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRO-222	ENST00000484031	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
TRO-222	ENST00000484031	ROMO1	P60602	79 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TRO-222	ENST00000484031	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRO-222	ENST00000484031	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRO-222	ENST00000484031	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TRO-222	ENST00000484031	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRO-222	ENST00000484031	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRO-222	ENST00000484031	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TRO-222	ENST00000484031	MT1A	P04731	61 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRO-222	ENST00000484031	MT3	P25713	68 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRO-222	ENST00000484031	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRO-222	ENST00000484031	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TRO-222	ENST00000484031	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TRO-222	ENST00000484031	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TRO-222	ENST00000484031	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TRO-222	ENST00000484031	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRO-222	ENST00000484031	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TRO-222	ENST00000484031	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TRO-222	ENST00000484031	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.56	□□□□□ -2
TRO-222	ENST00000484031	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.55	□□□□□ -2
TRO-222	ENST00000484031	INE1	O15225	51 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TRO-222	ENST00000484031	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.37	□□□□□ -2.03
TRO-222	ENST00000484031	PRM1	P04553	51 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TRO-222	ENST00000484031	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.79	□□□□□ -2.12

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.3 ms