RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 PMAIP1Q13794 54 aa4.99□□□□□ -1.61
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-9P26371 169 aa4.98□□□□□ -1.61
NISCH-208ENST00000481211 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
NISCH-208ENST00000481211 LCE3AQ5TA76 89 aa4.94□□□□□ -1.62
NISCH-208ENST00000481211 PP632Q6XCG6 107 aa4.93□□□□□ -1.62
NISCH-208ENST00000481211 KMT2DO14686 5537 aa4.93□□□□□ -1.62
NISCH-208ENST00000481211 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.89□□□□□ -1.63
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.85□□□□□ -1.63
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.83□□□□□ -1.64
NISCH-208ENST00000481211 MT1EP04732 61 aa4.8□□□□□ -1.64
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP12-3P60328 96 aa4.8□□□□□ -1.64
NISCH-208ENST00000481211 SPRR2EP22531 72 aa4.72□□□□□ -1.65
NISCH-208ENST00000481211 SPRR2BP35325 72 aa4.72□□□□□ -1.65
NISCH-208ENST00000481211 SPRR2AP35326 72 aa4.72□□□□□ -1.65
NISCH-208ENST00000481211 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.72□□□□□ -1.65
NISCH-208ENST00000481211 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.72□□□□□ -1.65
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.69□□□□□ -1.66
NISCH-208ENST00000481211 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.69□□□□□ -1.66
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.68□□□□□ -1.66
NISCH-208ENST00000481211 MT1LQ93083 61 aa4.66□□□□□ -1.66
NISCH-208ENST00000481211 NEBP20929 6669 aa4.66□□□□□ -1.66
NISCH-208ENST00000481211 MT1GP13640 62 aa4.65□□□□□ -1.67
NISCH-208ENST00000481211 PRAC1Q96KF2 57 aa4.62□□□□□ -1.67
NISCH-208ENST00000481211 MDN1Q9NU22 5596 aa4.61□□□□□ -1.67
NISCH-208ENST00000481211 SPRR2DP22532 72 aa4.57□□□□□ -1.68
NISCH-208ENST00000481211 MT1MQ8N339 61 aa4.53□□□□□ -1.68
NISCH-208ENST00000481211 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.46□□□□□ -1.7
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.45□□□□□ -1.7
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.45□□□□□ -1.7
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.43□□□□□ -1.7
NISCH-208ENST00000481211 SVIPQ8NHG7 77 aa4.42□□□□□ -1.7
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.33□□□□□ -1.72
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.33□□□□□ -1.72
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.33□□□□□ -1.72
NISCH-208ENST00000481211 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
NISCH-208ENST00000481211 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.19□□□□□ -1.74
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.13□□□□□ -1.75
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.09□□□□□ -1.75
NISCH-208ENST00000481211 MT1AP04731 61 aa3.99□□□□□ -1.77
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP12-4P60329 112 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-208ENST00000481211 LUZP6Q538Z0 58 aa3.94□□□□□ -1.78
NISCH-208ENST00000481211 MT4P47944 62 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.89□□□□□ -1.79
NISCH-208ENST00000481211 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.82□□□□□ -1.8
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.79□□□□□ -1.8
NISCH-208ENST00000481211 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.79□□□□□ -1.8
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.67□□□□□ -1.82
NISCH-208ENST00000481211 MT3P25713 68 aa3.65□□□□□ -1.83
NISCH-208ENST00000481211 LCE1EQ5T753 118 aa3.65□□□□□ -1.83
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.64□□□□□ -1.83
NISCH-208ENST00000481211 NDUFAF8A1L188 74 aa3.54□□□□□ -1.84
NISCH-208ENST00000481211 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.49□□□□□ -1.85
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.44□□□□□ -1.86
NISCH-208ENST00000481211 A0A0A0MQY5 61 aa3.41□□□□□ -1.86
NISCH-208ENST00000481211 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.37□□□□□ -1.87
NISCH-208ENST00000481211 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.31□□□□□ -1.88
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.29□□□□□ -1.88
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.27□□□□□ -1.89
NISCH-208ENST00000481211 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.25□□□□□ -1.89
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-8O75690 187 aa3.25□□□□□ -1.89
NISCH-208ENST00000481211 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.19□□□□□ -1.9
NISCH-208ENST00000481211 LCE1FQ5T754 118 aa3.18□□□□□ -1.9
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.16□□□□□ -1.9
NISCH-208ENST00000481211 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.92
NISCH-208ENST00000481211 INE1O15225 51 aa3.03□□□□□ -1.92
NISCH-208ENST00000481211 LCE1CQ5T751 118 aa3.02□□□□□ -1.93
NISCH-208ENST00000481211 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.02□□□□□ -1.93
NISCH-208ENST00000481211 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
NISCH-208ENST00000481211 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NISCH-208ENST00000481211 PRM1P04553 51 aa2.61□□□□□ -1.99
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.58□□□□□ -2
NISCH-208ENST00000481211 PHGR1C9JFL3 82 aa2.3□□□□□ -2.04
NISCH-208ENST00000481211 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2□□□□□ -2.09
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.57□□□□□ -2.16
NISCH-208ENST00000481211 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.5□□□□□ -2.17
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