RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.84□□□□□ -1.63
HPS1-211ENST00000478087 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.83□□□□□ -1.64
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.8□□□□□ -1.64
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.78□□□□□ -1.64
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.74□□□□□ -1.65
HPS1-211ENST00000478087 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.74□□□□□ -1.65
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.73□□□□□ -1.65
HPS1-211ENST00000478087 MT1GP13640 62 aa4.67□□□□□ -1.66
HPS1-211ENST00000478087 LCE3AQ5TA76 89 aa4.67□□□□□ -1.66
HPS1-211ENST00000478087 MT1LQ93083 61 aa4.63□□□□□ -1.67
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.62□□□□□ -1.67
HPS1-211ENST00000478087 MT1MQ8N339 61 aa4.62□□□□□ -1.67
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.61□□□□□ -1.67
HPS1-211ENST00000478087 ROMO1P60602 79 aa4.59□□□□□ -1.67
HPS1-211ENST00000478087 PP632Q6XCG6 107 aa4.58□□□□□ -1.68
HPS1-211ENST00000478087 LCE1DQ5T752 114 aa4.56□□□□□ -1.68
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP12-3P60328 96 aa4.54□□□□□ -1.68
HPS1-211ENST00000478087 MT4P47944 62 aa4.52□□□□□ -1.69
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.49□□□□□ -1.69
HPS1-211ENST00000478087 LCE4AQ5TA78 99 aa4.48□□□□□ -1.69
HPS1-211ENST00000478087 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.48□□□□□ -1.69
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.46□□□□□ -1.7
HPS1-211ENST00000478087 BRK1Q8WUW1 75 aa4.45□□□□□ -1.7
HPS1-211ENST00000478087 PRO0628Q9UI54 55 aa4.45□□□□□ -1.7
HPS1-211ENST00000478087 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.43□□□□□ -1.7
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.43□□□□□ -1.7
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.42□□□□□ -1.7
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.34□□□□□ -1.71
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.31□□□□□ -1.72
HPS1-211ENST00000478087 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.29□□□□□ -1.72
HPS1-211ENST00000478087 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.25□□□□□ -1.73
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
HPS1-211ENST00000478087 PMAIP1Q13794 54 aa4.22□□□□□ -1.73
HPS1-211ENST00000478087 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.2□□□□□ -1.74
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.2□□□□□ -1.74
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.19□□□□□ -1.74
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.15□□□□□ -1.75
HPS1-211ENST00000478087 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP12-4P60329 112 aa4.1□□□□□ -1.75
HPS1-211ENST00000478087 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.07□□□□□ -1.76
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.95□□□□□ -1.78
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.92□□□□□ -1.78
HPS1-211ENST00000478087 PRAC1Q96KF2 57 aa3.92□□□□□ -1.78
HPS1-211ENST00000478087 MT1AP04731 61 aa3.91□□□□□ -1.78
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.87□□□□□ -1.79
HPS1-211ENST00000478087 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.84□□□□□ -1.79
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.81□□□□□ -1.8
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.78□□□□□ -1.8
HPS1-211ENST00000478087 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.76□□□□□ -1.81
HPS1-211ENST00000478087 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
HPS1-211ENST00000478087 MUC5ACP98088 5654 aa3.73□□□□□ -1.81
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-8O75690 187 aa3.73□□□□□ -1.81
HPS1-211ENST00000478087 MT3P25713 68 aa3.56□□□□□ -1.84
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.5□□□□□ -1.85
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.5□□□□□ -1.85
HPS1-211ENST00000478087 H3BS24 57 aa3.49□□□□□ -1.85
HPS1-211ENST00000478087 LUZP6Q538Z0 58 aa3.42□□□□□ -1.86
HPS1-211ENST00000478087 LCE1EQ5T753 118 aa3.27□□□□□ -1.89
HPS1-211ENST00000478087 A0A0A0MQY5 61 aa3.17□□□□□ -1.9
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.16□□□□□ -1.9
HPS1-211ENST00000478087 NDUFAF8A1L188 74 aa3.15□□□□□ -1.91
HPS1-211ENST00000478087 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.15□□□□□ -1.91
HPS1-211ENST00000478087 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.09□□□□□ -1.91
HPS1-211ENST00000478087 LCE1CQ5T751 118 aa3.05□□□□□ -1.92
HPS1-211ENST00000478087 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.96□□□□□ -1.94
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.94□□□□□ -1.94
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.76□□□□□ -1.97
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HPS1-211ENST00000478087 INE1O15225 51 aa2.73□□□□□ -1.97
HPS1-211ENST00000478087 LCE1FQ5T754 118 aa2.67□□□□□ -1.98
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.6□□□□□ -1.99
HPS1-211ENST00000478087 PHGR1C9JFL3 82 aa2.59□□□□□ -1.99
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.45□□□□□ -2.02
HPS1-211ENST00000478087 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.32□□□□□ -2.04
HPS1-211ENST00000478087 PRM1P04553 51 aa2.32□□□□□ -2.04
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.91□□□□□ -2.1
HPS1-211ENST00000478087 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.62□□□□□ -2.15
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