RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPRR2BP35325 72 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPRR2AP35326 72 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.14□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.07□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LUZP6Q538Z0 58 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.04□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.04□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPRR2DP22532 72 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT1EP04732 61 aa4.97□□□□□ -1.61
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.95□□□□□ -1.62
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE3BQ5TA77 95 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT1LQ93083 61 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT1GP13640 62 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFAF8A1L188 74 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT1MQ8N339 61 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0A0MQY5 61 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.61□□□□□ -1.67
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.6□□□□□ -1.67
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.58□□□□□ -1.68
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.48□□□□□ -1.69
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE1DQ5T752 114 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT4P47944 62 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE4AQ5TA78 99 aa4.4□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.34□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.28□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.28□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT1AP04731 61 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INE1O15225 51 aa4.1□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.09□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.07□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.06□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.06□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP12-4P60329 112 aa4.03□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4□□□□□ -1.77
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.97□□□□□ -1.77
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.87□□□□□ -1.79
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT3P25713 68 aa3.85□□□□□ -1.79
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.79□□□□□ -1.8
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.77□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.75□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.73□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.64□□□□□ -1.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-8O75690 187 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.55□□□□□ -1.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MUC5ACP98088 5654 aa3.52□□□□□ -1.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.36□□□□□ -1.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE1EQ5T753 118 aa3.33□□□□□ -1.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.32□□□□□ -1.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRM1P04553 51 aa3.14□□□□□ -1.91
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE1CQ5T751 118 aa3.07□□□□□ -1.92
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.07□□□□□ -1.92
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.75□□□□□ -1.97
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.66□□□□□ -1.98
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHGR1C9JFL3 82 aa2.49□□□□□ -2.01
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.31□□□□□ -2.04
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.22□□□□□ -2.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.93□□□□□ -2.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.52□□□□□ -2.17
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