RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470815.1

HERC3-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-208ENST00000470815 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
HERC3-208ENST00000470815 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.6□□□□□ -2.5
HERC3-208ENST00000470815 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.6□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 DEFB131AP59861 70 aa-0.6□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.6□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 CDH23Q9H251 3354 aa-0.61□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 MT1FP04733 61 aa-0.61□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 SMIM2Q9BVW6 85 aa-0.61□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 LMO7Q8WWI1 1683 aa-0.62□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 SYCP2Q9BX26 1530 aa-0.62□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 FRYLO94915 3013 aa-0.62□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 CMC2Q9NRP2 79 aa-0.64□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 BRCA2P51587 3418 aa-0.64□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.65□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.65□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 LEAP2Q969E1 77 aa-0.65□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 UTRNP46939 3433 aa-0.65□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 MROH2AA6NES4 1674 aa-0.65□□□□□ -2.51
HERC3-208ENST00000470815 DEFB4AO15263 64 aa-0.66□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.67□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 ADCY10Q96PN6 1610 aa-0.67□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 NFAT5O94916 1531 aa-0.67□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-0.67□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 ABCC8Q09428 1581 aa-0.68□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-0.69□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.69□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-0.69□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 IQGAP1P46940 1657 aa-0.69□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.69□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.7□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 NDUFA1O15239 70 aa-0.7□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 CENPFP49454 3210 aa-0.71□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 TRPM2O94759 1503 aa-0.72□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.72□□□□□ -2.52
HERC3-208ENST00000470815 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-0.73□□□□□ -2.53
HERC3-208ENST00000470815 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.73□□□□□ -2.53
HERC3-208ENST00000470815 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
HERC3-208ENST00000470815 CLTCL1P53675 1640 aa-0.75□□□□□ -2.53
HERC3-208ENST00000470815 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.77□□□□□ -2.53
HERC3-208ENST00000470815 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.79□□□□□ -2.54
HERC3-208ENST00000470815 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
HERC3-208ENST00000470815 TOMM5Q8N4H5 51 aa-0.83□□□□□ -2.54
HERC3-208ENST00000470815 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.83□□□□□ -2.54
HERC3-208ENST00000470815 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.85□□□□□ -2.55
HERC3-208ENST00000470815 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.87□□□□□ -2.55
HERC3-208ENST00000470815 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
HERC3-208ENST00000470815 A0A096LNI7 61 aa-0.9□□□□□ -2.55
HERC3-208ENST00000470815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-0.91□□□□□ -2.55
HERC3-208ENST00000470815 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.91□□□□□ -2.56
HERC3-208ENST00000470815 IQGAP2Q13576 1575 aa-0.91□□□□□ -2.56
HERC3-208ENST00000470815 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-0.92□□□□□ -2.56
HERC3-208ENST00000470815 ATP7AQ04656 1500 aa-0.94□□□□□ -2.56
HERC3-208ENST00000470815 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.95□□□□□ -2.56
HERC3-208ENST00000470815 HTN1P15515 57 aa-0.96□□□□□ -2.56
HERC3-208ENST00000470815 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
HERC3-208ENST00000470815 CD52P31358 61 aa-1.02□□□□□ -2.57
HERC3-208ENST00000470815 DEFB124Q8NES8 71 aa-1.04□□□□□ -2.58
HERC3-208ENST00000470815 MROH2BQ7Z745 1585 aa-1.06□□□□□ -2.58
HERC3-208ENST00000470815 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
HERC3-208ENST00000470815 K7EIM0 57 aa-1.12□□□□□ -2.59
HERC3-208ENST00000470815 LINC01556Q5JQF7 62 aa-1.12□□□□□ -2.59
HERC3-208ENST00000470815 H3BUX3 64 aa-1.14□□□□□ -2.59
HERC3-208ENST00000470815 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-1.16□□□□□ -2.6
HERC3-208ENST00000470815 PRCDQ00LT1 54 aa-1.19□□□□□ -2.6
HERC3-208ENST00000470815 HTN3P15516 51 aa-1.21□□□□□ -2.6
HERC3-208ENST00000470815 H3BSH0 61 aa-1.22□□□□□ -2.6
HERC3-208ENST00000470815 APELAP0DMC3 54 aa-1.23□□□□□ -2.61
HERC3-208ENST00000470815 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-1.24□□□□□ -2.61
HERC3-208ENST00000470815 A0A096LPF7 62 aa-1.25□□□□□ -2.61
HERC3-208ENST00000470815 STATHP02808 62 aa-1.28□□□□□ -2.61
HERC3-208ENST00000470815 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-1.28□□□□□ -2.61
HERC3-208ENST00000470815 RPL39P5Q59GN2 51 aa-1.31□□□□□ -2.62
HERC3-208ENST00000470815 DEFB108AA8MXU0 73 aa-1.34□□□□□ -2.62
HERC3-208ENST00000470815 COX14Q96I36 57 aa-1.37□□□□□ -2.63
HERC3-208ENST00000470815 DEFB108BQ8NET1 73 aa-1.38□□□□□ -2.63
HERC3-208ENST00000470815 Q9Y3F1 56 aa-1.38□□□□□ -2.63
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