RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.4□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TGP01266 2768 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR2BP35325 72 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB108BQ8NET1 73 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SPG11Q96JI7 2443 aa0.39□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 USH2AO75445 5202 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BSH0 61 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZANQ9Y493 2812 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TENM2Q9NT68 2774 aa0.38□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BUX3 64 aa0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB136Q30KP8 78 aa0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SSPOA2VEC9 5147 aa0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KMT2DO14686 5537 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 COL7A1Q02388 2944 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB4AO15263 64 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 LEAP2Q969E1 77 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 NEBP20929 6669 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MDN1Q9NU22 5596 aa0.34□□□□□ -2.35
RABGGTB-205ENST00000462042 APELAP0DMC3 54 aa0.34□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.34□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HTN3P15516 51 aa0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR2AP35326 72 aa0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TTTY10Q9BZA0 68 aa0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A096LPF7 62 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB1P60022 68 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL39P5Q59GN2 51 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1HL1P0DM35 61 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 HTN1P15515 57 aa0.3□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 K7EIM0 57 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1AP04731 61 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1HP80294 61 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PRCDQ00LT1 54 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01556Q5JQF7 62 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A096LNI7 61 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR2EP22531 72 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 MT2AP02795 61 aa0.25□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1FP04733 61 aa0.25□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1BP07438 61 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MT4P47944 62 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1XP80297 61 aa0.19□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.19□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.19□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.18□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1EP04732 61 aa0.17□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.17□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.17□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1GP13640 62 aa0.16□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1MQ8N339 61 aa0.16□□□□□ -2.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MT1LQ93083 61 aa0.15□□□□□ -2.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.14□□□□□ -2.39
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