RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.7□□□□□ -1.34
DDR1-241ENST00000460944 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.68□□□□□ -1.34
DDR1-241ENST00000460944 LCE3BQ5TA77 95 aa6.66□□□□□ -1.34
DDR1-241ENST00000460944 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.6□□□□□ -1.35
DDR1-241ENST00000460944 MT1GP13640 62 aa6.59□□□□□ -1.35
DDR1-241ENST00000460944 PP632Q6XCG6 107 aa6.59□□□□□ -1.35
DDR1-241ENST00000460944 MT1LQ93083 61 aa6.57□□□□□ -1.36
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP12-3P60328 96 aa6.54□□□□□ -1.36
DDR1-241ENST00000460944 MT1MQ8N339 61 aa6.48□□□□□ -1.37
DDR1-241ENST00000460944 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
DDR1-241ENST00000460944 ROMO1P60602 79 aa6.47□□□□□ -1.37
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.45□□□□□ -1.38
DDR1-241ENST00000460944 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.41□□□□□ -1.38
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.29□□□□□ -1.4
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.23□□□□□ -1.41
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.21□□□□□ -1.42
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.21□□□□□ -1.42
DDR1-241ENST00000460944 BRK1Q8WUW1 75 aa6.21□□□□□ -1.42
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.18□□□□□ -1.42
DDR1-241ENST00000460944 LCE4AQ5TA78 99 aa6.1□□□□□ -1.43
DDR1-241ENST00000460944 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.04□□□□□ -1.44
DDR1-241ENST00000460944 LCE1DQ5T752 114 aa6□□□□□ -1.45
DDR1-241ENST00000460944 MT4P47944 62 aa5.99□□□□□ -1.45
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.99□□□□□ -1.45
DDR1-241ENST00000460944 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.93□□□□□ -1.46
DDR1-241ENST00000460944 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.91□□□□□ -1.46
DDR1-241ENST00000460944 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.89□□□□□ -1.47
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
DDR1-241ENST00000460944 PMAIP1Q13794 54 aa5.84□□□□□ -1.47
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.81□□□□□ -1.48
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP12-4P60329 112 aa5.73□□□□□ -1.49
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.69□□□□□ -1.5
DDR1-241ENST00000460944 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.67□□□□□ -1.5
DDR1-241ENST00000460944 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.65□□□□□ -1.5
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.64□□□□□ -1.51
DDR1-241ENST00000460944 PRO0628Q9UI54 55 aa5.63□□□□□ -1.51
DDR1-241ENST00000460944 MT1AP04731 61 aa5.61□□□□□ -1.51
DDR1-241ENST00000460944 PRAC1Q96KF2 57 aa5.54□□□□□ -1.52
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.53□□□□□ -1.52
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.51□□□□□ -1.53
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.49□□□□□ -1.53
DDR1-241ENST00000460944 SVIPQ8NHG7 77 aa5.38□□□□□ -1.55
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.38□□□□□ -1.55
DDR1-241ENST00000460944 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.33□□□□□ -1.56
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.3□□□□□ -1.56
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.24□□□□□ -1.57
DDR1-241ENST00000460944 MT3P25713 68 aa5.13□□□□□ -1.59
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.1□□□□□ -1.59
DDR1-241ENST00000460944 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
DDR1-241ENST00000460944 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.93□□□□□ -1.62
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-8O75690 187 aa4.9□□□□□ -1.63
DDR1-241ENST00000460944 MUC5ACP98088 5654 aa4.89□□□□□ -1.63
DDR1-241ENST00000460944 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
DDR1-241ENST00000460944 LUZP6Q538Z0 58 aa4.72□□□□□ -1.65
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.69□□□□□ -1.66
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.65□□□□□ -1.67
DDR1-241ENST00000460944 LCE1EQ5T753 118 aa4.62□□□□□ -1.67
DDR1-241ENST00000460944 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.43□□□□□ -1.7
DDR1-241ENST00000460944 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.35□□□□□ -1.71
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.32□□□□□ -1.72
DDR1-241ENST00000460944 LCE1CQ5T751 118 aa4.29□□□□□ -1.72
DDR1-241ENST00000460944 H3BS24 57 aa4.21□□□□□ -1.74
DDR1-241ENST00000460944 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.21□□□□□ -1.74
DDR1-241ENST00000460944 NDUFAF8A1L188 74 aa3.98□□□□□ -1.77
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.86□□□□□ -1.79
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.82□□□□□ -1.8
DDR1-241ENST00000460944 LCE1FQ5T754 118 aa3.7□□□□□ -1.82
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.62□□□□□ -1.83
DDR1-241ENST00000460944 A0A0A0MQY5 61 aa3.41□□□□□ -1.86
DDR1-241ENST00000460944 PHGR1C9JFL3 82 aa3.37□□□□□ -1.87
DDR1-241ENST00000460944 PRM1P04553 51 aa3.31□□□□□ -1.88
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.29□□□□□ -1.88
DDR1-241ENST00000460944 INE1O15225 51 aa3.26□□□□□ -1.89
DDR1-241ENST00000460944 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.01□□□□□ -1.93
DDR1-241ENST00000460944 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.52□□□□□ -2.01
DDR1-241ENST00000460944 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.13□□□□□ -2.07
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