RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.02□□□□□ -1.77
GARNL3-211ENST00000460176 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4□□□□□ -1.77
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-9P26371 169 aa3.97□□□□□ -1.77
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.97□□□□□ -1.77
GARNL3-211ENST00000460176 TNP1P09430 55 aa3.95□□□□□ -1.78
GARNL3-211ENST00000460176 KMT2DO14686 5537 aa3.92□□□□□ -1.78
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.9□□□□□ -1.79
GARNL3-211ENST00000460176 BRK1Q8WUW1 75 aa3.89□□□□□ -1.79
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.88□□□□□ -1.79
GARNL3-211ENST00000460176 LCE3AQ5TA76 89 aa3.87□□□□□ -1.79
GARNL3-211ENST00000460176 ROMO1P60602 79 aa3.85□□□□□ -1.79
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.84□□□□□ -1.79
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GARNL3-211ENST00000460176 MT1EP04732 61 aa3.79□□□□□ -1.8
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR2EP22531 72 aa3.78□□□□□ -1.8
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR2BP35325 72 aa3.78□□□□□ -1.8
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR2AP35326 72 aa3.78□□□□□ -1.8
GARNL3-211ENST00000460176 NEBP20929 6669 aa3.74□□□□□ -1.81
GARNL3-211ENST00000460176 LCE1FQ5T754 118 aa3.74□□□□□ -1.81
GARNL3-211ENST00000460176 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.72□□□□□ -1.81
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GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.69□□□□□ -1.82
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GARNL3-211ENST00000460176 PP632Q6XCG6 107 aa3.66□□□□□ -1.82
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR2DP22532 72 aa3.65□□□□□ -1.83
GARNL3-211ENST00000460176 PMAIP1Q13794 54 aa3.65□□□□□ -1.83
GARNL3-211ENST00000460176 PRO0628Q9UI54 55 aa3.65□□□□□ -1.83
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GARNL3-211ENST00000460176 MT1GP13640 62 aa3.63□□□□□ -1.83
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.59□□□□□ -1.83
GARNL3-211ENST00000460176 LCE1EQ5T753 118 aa3.59□□□□□ -1.83
GARNL3-211ENST00000460176 MT1MQ8N339 61 aa3.58□□□□□ -1.84
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.57□□□□□ -1.84
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.57□□□□□ -1.84
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.54□□□□□ -1.84
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.51□□□□□ -1.85
GARNL3-211ENST00000460176 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.5□□□□□ -1.85
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.47□□□□□ -1.85
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GARNL3-211ENST00000460176 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.42□□□□□ -1.86
GARNL3-211ENST00000460176 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.27□□□□□ -1.89
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.26□□□□□ -1.89
GARNL3-211ENST00000460176 MT4P47944 62 aa3.17□□□□□ -1.9
GARNL3-211ENST00000460176 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.17□□□□□ -1.9
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.16□□□□□ -1.9
GARNL3-211ENST00000460176 MT1AP04731 61 aa3.12□□□□□ -1.91
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.08□□□□□ -1.92
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP12-4P60329 112 aa3.07□□□□□ -1.92
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.05□□□□□ -1.92
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.02□□□□□ -1.93
GARNL3-211ENST00000460176 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.01□□□□□ -1.93
GARNL3-211ENST00000460176 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
GARNL3-211ENST00000460176 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.97□□□□□ -1.93
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.91□□□□□ -1.94
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.89□□□□□ -1.95
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.86□□□□□ -1.95
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.8□□□□□ -1.96
GARNL3-211ENST00000460176 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.78□□□□□ -1.96
GARNL3-211ENST00000460176 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.74□□□□□ -1.97
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.66□□□□□ -1.98
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP5-8O75690 187 aa2.62□□□□□ -1.99
GARNL3-211ENST00000460176 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.6□□□□□ -1.99
GARNL3-211ENST00000460176 LCE1CQ5T751 118 aa2.37□□□□□ -2.03
GARNL3-211ENST00000460176 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.37□□□□□ -2.03
GARNL3-211ENST00000460176 MUC5ACP98088 5654 aa2.36□□□□□ -2.03
GARNL3-211ENST00000460176 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
GARNL3-211ENST00000460176 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
GARNL3-211ENST00000460176 INE1O15225 51 aa2.13□□□□□ -2.07
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.04□□□□□ -2.08
GARNL3-211ENST00000460176 PRM1P04553 51 aa1.99□□□□□ -2.09
GARNL3-211ENST00000460176 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.89□□□□□ -2.11
GARNL3-211ENST00000460176 PHGR1C9JFL3 82 aa1.81□□□□□ -2.12
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.21□□□□□ -2.22
GARNL3-211ENST00000460176 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.07□□□□□ -2.24
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