RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q1T7F1 81 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE3AQ5TA76 89 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLAC4Q8WY50 150 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1XP80297 61 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KMT2DO14686 5537 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0D9SG42 100 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROMO1P60602 79 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MDN1Q9NU22 5596 aa3.33□□□□□ -1.88
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GU69 56 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEBP20929 6669 aa3.31□□□□□ -1.88
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP12-1P59990 96 aa3.28□□□□□ -1.88
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-9P26371 169 aa3.27□□□□□ -1.89
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.25□□□□□ -1.89
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR15LQ9BU68 103 aa3.22□□□□□ -1.89
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRK1Q8WUW1 75 aa3.18□□□□□ -1.9
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP12-3P60328 96 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR2EP22531 72 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR2BP35325 72 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR2AP35326 72 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UQCR11O14957 56 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.11□□□□□ -1.91
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.06□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INE1O15225 51 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR2DP22532 72 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1EP04732 61 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNP1P09430 55 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE1CQ5T751 118 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP12-4P60329 112 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1LQ93083 61 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1MQ8N339 61 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1GP13640 62 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT4P47944 62 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1AP04731 61 aa2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.38□□□□□ -2.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.34□□□□□ -2.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-8O75690 187 aa2.24□□□□□ -2.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.23□□□□□ -2.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC5ACP98088 5654 aa2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRM1P04553 51 aa1.49□□□□□ -2.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHGR1C9JFL3 82 aa1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.11□□□□□ -2.23
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