RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.7□□□□□ -1.66
PRAME-210ENST00000442481 K7ERS5 55 aa4.69□□□□□ -1.66
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PRAME-210ENST00000442481 LCE1DQ5T752 114 aa4.64□□□□□ -1.67
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-12P60413 245 aa4.62□□□□□ -1.67
PRAME-210ENST00000442481 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.61□□□□□ -1.67
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.56□□□□□ -1.68
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.55□□□□□ -1.68
PRAME-210ENST00000442481 LCE4AQ5TA78 99 aa4.55□□□□□ -1.68
PRAME-210ENST00000442481 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.53□□□□□ -1.68
PRAME-210ENST00000442481 PRO0628Q9UI54 55 aa4.48□□□□□ -1.69
PRAME-210ENST00000442481 SVIPQ8NHG7 77 aa4.47□□□□□ -1.69
PRAME-210ENST00000442481 ROMO1P60602 79 aa4.45□□□□□ -1.7
PRAME-210ENST00000442481 TNP1P09430 55 aa4.43□□□□□ -1.7
PRAME-210ENST00000442481 PMAIP1Q13794 54 aa4.43□□□□□ -1.7
PRAME-210ENST00000442481 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.42□□□□□ -1.7
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.42□□□□□ -1.7
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.38□□□□□ -1.71
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.37□□□□□ -1.71
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.35□□□□□ -1.71
PRAME-210ENST00000442481 MT1EP04732 61 aa4.32□□□□□ -1.72
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.32□□□□□ -1.72
PRAME-210ENST00000442481 PP632Q6XCG6 107 aa4.3□□□□□ -1.72
PRAME-210ENST00000442481 MT4P47944 62 aa4.29□□□□□ -1.72
PRAME-210ENST00000442481 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.28□□□□□ -1.72
PRAME-210ENST00000442481 MT1GP13640 62 aa4.27□□□□□ -1.73
PRAME-210ENST00000442481 LCE3AQ5TA76 89 aa4.27□□□□□ -1.73
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.27□□□□□ -1.73
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.26□□□□□ -1.73
PRAME-210ENST00000442481 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.25□□□□□ -1.73
PRAME-210ENST00000442481 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.19□□□□□ -1.74
PRAME-210ENST00000442481 PRAC1Q96KF2 57 aa4.19□□□□□ -1.74
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.15□□□□□ -1.75
PRAME-210ENST00000442481 MT1MQ8N339 61 aa4.14□□□□□ -1.75
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.13□□□□□ -1.75
PRAME-210ENST00000442481 MT1LQ93083 61 aa4.11□□□□□ -1.75
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP12-3P60328 96 aa4.1□□□□□ -1.75
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.09□□□□□ -1.75
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.07□□□□□ -1.76
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.06□□□□□ -1.76
PRAME-210ENST00000442481 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.98□□□□□ -1.77
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.93□□□□□ -1.78
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP12-4P60329 112 aa3.89□□□□□ -1.79
PRAME-210ENST00000442481 A0A0A0MQY5 61 aa3.83□□□□□ -1.8
PRAME-210ENST00000442481 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.81□□□□□ -1.8
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PRAME-210ENST00000442481 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PRAME-210ENST00000442481 MUC5ACP98088 5654 aa3.59□□□□□ -1.83
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.59□□□□□ -1.83
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-8O75690 187 aa3.58□□□□□ -1.84
PRAME-210ENST00000442481 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.56□□□□□ -1.84
PRAME-210ENST00000442481 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PRAME-210ENST00000442481 MT1AP04731 61 aa3.49□□□□□ -1.85
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.47□□□□□ -1.85
PRAME-210ENST00000442481 LUZP6Q538Z0 58 aa3.44□□□□□ -1.86
PRAME-210ENST00000442481 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.41□□□□□ -1.86
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.37□□□□□ -1.87
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.27□□□□□ -1.89
PRAME-210ENST00000442481 MT3P25713 68 aa3.26□□□□□ -1.89
PRAME-210ENST00000442481 NDUFAF8A1L188 74 aa3.23□□□□□ -1.89
PRAME-210ENST00000442481 LCE1EQ5T753 118 aa3.05□□□□□ -1.92
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.95□□□□□ -1.94
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PRAME-210ENST00000442481 LCE1FQ5T754 118 aa2.88□□□□□ -1.95
PRAME-210ENST00000442481 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.86□□□□□ -1.95
PRAME-210ENST00000442481 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.83□□□□□ -1.96
PRAME-210ENST00000442481 LCE1CQ5T751 118 aa2.82□□□□□ -1.96
PRAME-210ENST00000442481 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.74□□□□□ -1.97
PRAME-210ENST00000442481 INE1O15225 51 aa2.64□□□□□ -1.99
PRAME-210ENST00000442481 PHGR1C9JFL3 82 aa2.5□□□□□ -2.01
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.48□□□□□ -2.01
PRAME-210ENST00000442481 PRM1P04553 51 aa2.33□□□□□ -2.04
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.27□□□□□ -2.05
PRAME-210ENST00000442481 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.08□□□□□ -2.08
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.92□□□□□ -2.1
PRAME-210ENST00000442481 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.48□□□□□ -2.17
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