RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB1P60022 68 aa1.54□□□□□ -2.16
CBX1P4-201ENST00000439415 KLK9Q2XQG4 91 aa1.54□□□□□ -2.16
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BUA1 57 aa1.53□□□□□ -2.16
CBX1P4-201ENST00000439415 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa1.53□□□□□ -2.16
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR1AP35321 89 aa1.52□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB105AQ8NG35 78 aa1.52□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 HTN1P15515 57 aa1.5□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 HTN3P15516 51 aa1.5□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PRLHP81277 87 aa1.49□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.48□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR1BP22528 89 aa1.48□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.48□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 S4R3F8 94 aa1.48□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.45□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 SPART-AS1P0CW21 52 aa1.45□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PRO0255Q9UI72 69 aa1.45□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 KMT2DO14686 5537 aa1.44□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A096LPF7 62 aa1.43□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0D9SG42 100 aa1.43□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 SPINK1P00995 79 aa1.43□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 MDN1Q9NU22 5596 aa1.42□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1HP80294 61 aa1.42□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.42□□□□□ -2.18
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.4□□□□□ -2.19
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.37□□□□□ -2.19
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BNG1 76 aa1.35□□□□□ -2.19
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.34□□□□□ -2.19
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01556Q5JQF7 62 aa1.34□□□□□ -2.19
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.34□□□□□ -2.19
CBX1P4-201ENST00000439415 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.33□□□□□ -2.2
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.31□□□□□ -2.2
CBX1P4-201ENST00000439415 M0R2T5 61 aa1.3□□□□□ -2.2
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A096LNI7 61 aa1.29□□□□□ -2.2
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.28□□□□□ -2.2
CBX1P4-201ENST00000439415 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.25□□□□□ -2.21
CBX1P4-201ENST00000439415 M0QZ58 72 aa1.25□□□□□ -2.21
CBX1P4-201ENST00000439415 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
CBX1P4-201ENST00000439415 MT2AP02795 61 aa1.24□□□□□ -2.21
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1FP04733 61 aa1.24□□□□□ -2.21
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.22□□□□□ -2.21
CBX1P4-201ENST00000439415 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.21□□□□□ -2.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR2EP22531 72 aa1.2□□□□□ -2.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR2BP35325 72 aa1.2□□□□□ -2.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR2AP35326 72 aa1.2□□□□□ -2.22
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.2□□□□□ -2.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR2DP22532 72 aa1.16□□□□□ -2.22
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.15□□□□□ -2.23
CBX1P4-201ENST00000439415 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf92A6NGG3 77 aa1.12□□□□□ -2.23
CBX1P4-201ENST00000439415 TNP1P09430 55 aa1.11□□□□□ -2.23
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS29P62273 56 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.08□□□□□ -2.24
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
CBX1P4-201ENST00000439415 MT4P47944 62 aa1.07□□□□□ -2.24
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1BP07438 61 aa1.06□□□□□ -2.24
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC5ACP98088 5654 aa1.05□□□□□ -2.24
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa1.02□□□□□ -2.25
CBX1P4-201ENST00000439415 PRM1P04553 51 aa0.97□□□□□ -2.25
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.97□□□□□ -2.25
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1XP80297 61 aa0.91□□□□□ -2.26
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.91□□□□□ -2.26
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.91□□□□□ -2.26
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.88□□□□□ -2.27
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.83□□□□□ -2.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1EP04732 61 aa0.82□□□□□ -2.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1AP04731 61 aa0.81□□□□□ -2.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1MQ8N339 61 aa0.8□□□□□ -2.28
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1GP13640 62 aa0.78□□□□□ -2.28
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.78□□□□□ -2.28
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.74□□□□□ -2.29
CBX1P4-201ENST00000439415 MT1LQ93083 61 aa0.72□□□□□ -2.29
CBX1P4-201ENST00000439415 PHGR1C9JFL3 82 aa0.7□□□□□ -2.3
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.7□□□□□ -2.3
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.65□□□□□ -2.31
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