RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.37□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MT1GP13640 62 aa2.36□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPRR2EP22531 72 aa2.36□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPRR2BP35325 72 aa2.36□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPRR2AP35326 72 aa2.36□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.36□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KMT2DO14686 5537 aa2.35□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NEBP20929 6669 aa2.34□□□□□ -2.03
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.32□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.32□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.32□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.32□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.31□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MT1MQ8N339 61 aa2.31□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LUZP6Q538Z0 58 aa2.28□□□□□ -2.04
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPRR2DP22532 72 aa2.27□□□□□ -2.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.26□□□□□ -2.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.26□□□□□ -2.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.23□□□□□ -2.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.23□□□□□ -2.05
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.2□□□□□ -2.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE3BQ5TA77 95 aa2.18□□□□□ -2.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.17□□□□□ -2.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.17□□□□□ -2.06
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NDUFAF8A1L188 74 aa2.15□□□□□ -2.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MDN1Q9NU22 5596 aa2.14□□□□□ -2.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.12□□□□□ -2.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.11□□□□□ -2.07
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 H3BS24 57 aa2.05□□□□□ -2.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MT1AP04731 61 aa2.05□□□□□ -2.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.01□□□□□ -2.09
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE4AQ5TA78 99 aa2.01□□□□□ -2.09
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP12-4P60329 112 aa2□□□□□ -2.09
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MT4P47944 62 aa1.98□□□□□ -2.09
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.98□□□□□ -2.09
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa1.96□□□□□ -2.1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa1.96□□□□□ -2.1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A0A0A0MQY5 61 aa1.95□□□□□ -2.1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE1DQ5T752 114 aa1.92□□□□□ -2.1
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MT3P25713 68 aa1.88□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.88□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.88□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.88□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.87□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.86□□□□□ -2.11
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.81□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.81□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.79□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa1.79□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 INE1O15225 51 aa1.78□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.78□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.78□□□□□ -2.12
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.73□□□□□ -2.13
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.65□□□□□ -2.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.63□□□□□ -2.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE1EQ5T753 118 aa1.61□□□□□ -2.15
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.59□□□□□ -2.16
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MUC5ACP98088 5654 aa1.58□□□□□ -2.16
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-8O75690 187 aa1.57□□□□□ -2.16
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.57□□□□□ -2.16
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.55□□□□□ -2.16
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE1CQ5T751 118 aa1.49□□□□□ -2.17
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRM1P04553 51 aa1.48□□□□□ -2.17
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.31□□□□□ -2.2
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.3□□□□□ -2.2
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE1FQ5T754 118 aa1.22□□□□□ -2.21
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.21□□□□□ -2.22
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PHGR1C9JFL3 82 aa1.12□□□□□ -2.23
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.91□□□□□ -2.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.91□□□□□ -2.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.4 ms