RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.25□□□□□ -1.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.23□□□□□ -1.73
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.19□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LUZP6Q538Z0 58 aa4.19□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEBP20929 6669 aa4.18□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE1EQ5T753 118 aa4.15□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFAF8A1L188 74 aa4.13□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNP1P09430 55 aa4.13□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.12□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ROMO1P60602 79 aa4.1□□□□□ -1.75
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.07□□□□□ -1.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP10-12P60413 245 aa4.06□□□□□ -1.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.03□□□□□ -1.76
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.99□□□□□ -1.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.97□□□□□ -1.77
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.95□□□□□ -1.78
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE3AQ5TA76 89 aa3.92□□□□□ -1.78
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PP632Q6XCG6 107 aa3.91□□□□□ -1.78
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.88□□□□□ -1.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KMT2DO14686 5537 aa3.86□□□□□ -1.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-9P26371 169 aa3.85□□□□□ -1.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.83□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.82□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.81□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.8□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP12-3P60328 96 aa3.8□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.8□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.79□□□□□ -1.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT1EP04732 61 aa3.76□□□□□ -1.81
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.75□□□□□ -1.81
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRR2EP22531 72 aa3.74□□□□□ -1.81
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRR2BP35325 72 aa3.74□□□□□ -1.81
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRR2AP35326 72 aa3.74□□□□□ -1.81
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.68□□□□□ -1.82
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT3P25713 68 aa3.66□□□□□ -1.82
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT1LQ93083 61 aa3.66□□□□□ -1.82
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT1GP13640 62 aa3.64□□□□□ -1.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.63□□□□□ -1.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MDN1Q9NU22 5596 aa3.62□□□□□ -1.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRR2DP22532 72 aa3.62□□□□□ -1.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.62□□□□□ -1.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT1MQ8N339 61 aa3.56□□□□□ -1.84
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.52□□□□□ -1.85
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.48□□□□□ -1.85
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.42□□□□□ -1.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.4□□□□□ -1.87
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE1FQ5T754 118 aa3.34□□□□□ -1.87
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.34□□□□□ -1.88
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.26□□□□□ -1.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.25□□□□□ -1.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.22□□□□□ -1.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT1AP04731 61 aa3.13□□□□□ -1.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT4P47944 62 aa3.12□□□□□ -1.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP12-4P60329 112 aa3.12□□□□□ -1.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.11□□□□□ -1.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INE1O15225 51 aa3.09□□□□□ -1.91
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.07□□□□□ -1.92
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.98□□□□□ -1.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.89□□□□□ -1.95
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.88□□□□□ -1.95
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC5ACP98088 5654 aa2.84□□□□□ -1.95
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP5-8O75690 187 aa2.69□□□□□ -1.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE1CQ5T751 118 aa2.69□□□□□ -1.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.69□□□□□ -1.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.63□□□□□ -1.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRM1P04553 51 aa2.1□□□□□ -2.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHGR1C9JFL3 82 aa2.01□□□□□ -2.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.99□□□□□ -2.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.51□□□□□ -2.17
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms